ГОСТ Р 56140-2014. Национальный стандарт Российской Федерации. Средства лекарственные биологические для ветеринарного применения. Выявление ДНК микроорганизмов рода Mycoplasma методом полимеразной цепной реакции (ПЦР)
(утв. и введен в действие Приказом Росстандарта от 23.09.2014 № 1175-ст)
Примечание
Текст данного документа приведен с учетом поправок, опубликованных в «ИУС», № 8, 2016; № 6, 2021. Документ введен в действие с 1 января 2016 года.
Утвержден и введен в действие Приказом Федерального агентства по техническому регулированию и метрологии от 23 сентября 2014 г. № 1175-ст
НАЦИОНАЛЬНЫЙ СТАНДАРТ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
СРЕДСТВА ЛЕКАРСТВЕННЫЕ БИОЛОГИЧЕСКИЕ ДЛЯ ВЕТЕРИНАРНОГО ПРИМЕНЕНИЯ
ВЫЯВЛЕНИЕ ДНК МИКРООРГАНИЗМОВ РОДА MYCOPLASMA МЕТОДОМ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ (ПЦР)
Medicine biological remedies for veterinary use. Polymerase chain reaction for the Mycoplasma DNA detection
Дата введения 1 января 2016 года
Предисловие
1. Разработан Федеральным государственным бюджетным учреждением «Всероссийский государственный Центр качества и стандартизации лекарственных средств для животных и кормов» (ФГБУ «ВГНКИ»).
2. Внесен Техническим комитетом по стандартизации ТК 454 «Охрана жизни и здоровья животных и ветеринарно-санитарная безопасность продуктов животного происхождения и кормов».
3. Утвержден и введен в действие Приказом Федерального агентства по техническому регулированию и метрологии от 23 сентября 2014 г. № 1175-ст.
Правила применения настоящего стандарта установлены в ГОСТ Р 1.0-2012 (раздел 8). Информация об изменениях к настоящему стандарту публикуется в ежегодном (по состоянию на 1 января текущего года) информационном указателе «Национальные стандарты», а официальный текст изменений и поправок — в ежемесячном информационном указателе «Национальные стандарты». В случае пересмотра (замены) или отмены настоящего стандарта соответствующее уведомление будет опубликовано в ближайшем выпуске информационного указателя «Национальные стандарты». Соответствующая информация, уведомление и тексты размещаются также в информационной системе общего пользования — на официальном сайте Федерального агентства по техническому регулированию и метрологии в сети Интернет (gost.ru).
1. Область применения
Настоящий стандарт распространяется на биологические лекарственные средства для ветеринарного применения — живые вакцины, сыворотки крови, гипериммунные сыворотки — и устанавливает метод выявления ДНК микроорганизмов рода Mycoplasma методом полимеразной цепной реакции (ПЦР).
Настоящий метод также может быть применен для культуры клеток.
2. Нормативные ссылки
В настоящем стандарте использованы нормативные ссылки на следующие стандарты:
ГОСТ OIML R 76-1-2011 Весы неавтоматического действия. Часть 1. Метрологические и технические требования. Испытания
ГОСТ 1770-74 (ИСО 1042-83, ИСО 4788-80) Посуда мерная лабораторная стеклянная. Цилиндры, мензурки, колбы, пробирки. Общие технические условия
ГОСТ 3164-78 Масло вазелиновое медицинское. Технические условия
ГОСТ 5962-2013 Спирт этиловый ректификованный из пищевого сырья. Технические условия
ГОСТ 6709-72 Вода дистиллированная. Технические условия
ГОСТ ИСО/МЭК 17025-2006 Общие требования к компетентности испытательных и калибровочных лабораторий
ГОСТ 21400-75 Стекло химико-лабораторное. Технические требования. Методы испытаний
ГОСТ 24760-81 Халаты медицинские женские. Технические условия
ГОСТ 25194-82 Халаты медицинские мужские. Технические условия
ГОСТ 26678-85 Холодильники и морозильники бытовые электрические компрессионные параметрического ряда. Общие технические условия
ГОСТ 27025-86 Реактивы. Общие указания по проведению испытаний
ГОСТ 28311-89 Дозаторы медицинские лабораторные. Общие технические требования и методы испытаний
ГОСТ 31719-2012 Продукты пищевые и корма. Экспресс-метод определения сырьевого состава (молекулярный)
ГОСТ 31929-2013 Средства лекарственные для ветеринарного применения. Правила приемки, методы отбора проб
ГОСТ IEC 60335-2-25-2012 Безопасность бытовых и аналогичных электрических приборов. Часть 2.25. Частные требования для микроволновых печей, включая комбинированные микроволновые печи
ГОСТ Р 52173-2003 Сырье и продукты пищевые. Метод идентификации генетически модифицированных источников (ГМИ) растительного происхождения
ГОСТ Р 52239-2004 (ИСО 11193-1) Перчатки медицинские диагностические одноразовые. Часть 1. Спецификация на перчатки из каучукового латекса или раствора
ГОСТ Р 52833-2007 Микробиология пищевой продукции и кормов для животных. Метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) для определения патогенных микроорганизмов. Общие требования и определения
ГОСТ Р 55576-2013 Корма и кормовые добавки. Метод качественного определения регуляторных последовательностей в геноме сои и кукурузы.
Примечание. При пользовании настоящим стандартом целесообразно проверить действие ссылочных стандартов в информационной системе общего пользования — на официальном сайте Федерального агентства по техническому регулированию и метрологии в сети Интернет или по ежегодному информационному указателю «Национальные стандарты», который опубликован по состоянию на 1 января текущего года, и по выпускам ежемесячного информационного указателя «Национальные стандарты» за текущий год. Если заменен ссылочный стандарт, на который дана недатированная ссылка, то рекомендуется использовать действующую версию этого стандарта с учетом всех внесенных в данную версию изменений. Если заменен ссылочный стандарт, на который дана датированная ссылка, то рекомендуется использовать версию этого стандарта с указанным выше годом утверждения (принятия). Если после утверждения настоящего стандарта в ссылочный стандарт, на который дана датированная ссылка, внесено изменение, затрагивающее положение, на которое дана ссылка, то это положение рекомендуется применять без учета данного изменения. Если ссылочный стандарт отменен без замены, то положение, в котором дана ссылка на него, рекомендуется применять в части, не затрагивающей эту ссылку.
3. Термины, определения и сокращения
3.1. В настоящем стандарте применены термины по ГОСТ Р 52833, ГОСТ 31719 и ГОСТ 31929, а также следующие термины с соответствующими определениями.
3.1.1. Taq-полимераза: фермент, участвующий в процессе построения цепей нуклеиновых кислот из нуклеотидов.
3.1.2. Элюция: процесс вымывания ДНК из твердого носителя (сорбента) с использованием растворителя.
3.2 В настоящем стандарте применены следующие сокращения:
а) дНТФ — раствор, содержащий нуклеотиды:
-
2'-дезоксиаденозин-5'-трифосфорной кислоты тетранатриевую соль;
-
2'-дезоксицитидин-5'-трифосфорной кислоты тетранатриевую соль;
-
2'-дезоксигуанин-5'-трифосфорной кислоты тетранатриевую соль;
-
2'-дезокситимидин-5'-трифосфорной кислоты тетранатриевую соль;
б) ОКО — контрольный образец этапа экстракции;
в) ПКО — положительный контрольный образец, содержащий ДНК микроорганизмов рода Mycoplasma;
г) ПЦР — полимеразная цепная реакция;
д) ПЦР-буфер — реакционный буфер для проведения ПЦР;
е) ТБЕ-буфер — трис-боратный буфер;
и) ЭДТА — этилендиаминтетраацетат.
4. Сущность метода
Сущность метода ПЦР заключается в амплификации специфического участка ДНК микроорганизмов рода Mycoplasma за счет многократного повторения циклов денатурации ДНК в исследуемой пробе, отжига специфических олигонуклеотидных праймеров и синтеза комплементарных цепей ДНК с помощью фермента Taq-полимеразы. Наличие ДНК микроорганизмов рода Mycoplasma в исследуемой пробе определяют по появлению специфичной полосы амплифицированной ДНК длиной 509 п. н., просматриваемой на электрофореграмме.
5. Условия выполнения исследований и требования безопасности
При выполнении исследований следует соблюдать условия и требования безопасности, установленные в ГОСТ Р 52833 и ГОСТ Р 55576-2013 (раздел 4, приложение А).
Примечание. Работу с микроорганизмами I — IV групп патогенности проводят в соответствии с требованиями [1], [2] и [3].
6. Средства измерений, оборудование, материалы, реактивы и посуда
6.1 Общие требования — по ГОСТ ИСО/МЭК 17025.
6.2 Для проведения исследований применяют:
- микроцентрифугу-встряхиватель со скоростью вращения до 2000 об/мин;
- холодильник бытовой электрический компрессионный по ГОСТ 26678 с диапазоном температур от 2 °C до 8 °C и с морозильной камерой с температурой не более минус 16 °C;
- микропробирки одноразовые полипропиленовые вместимостью 0,5 или 0,2 см3 и завинчивающиеся или плотно закрывающиеся вместимостью 1,5 см3;
- набор дозаторов электронных или механических лабораторных медицинских по ГОСТ 28311 или переменного объема по ГОСТ Р 52173 (пункт 4.14);
- наконечники одноразовые для лабораторных медицинских дозаторов переменного объема с аэрозольным барьером вместимостью до 200 мм3 и до 1000 мм3;
- наконечники одноразовые для лабораторных медицинских дозаторов переменного объема до 200 мм3;
- штативы для микропробирок и наконечников;
- халаты медицинские по ГОСТ 24760 и 25194;
- перчатки медицинские диагностические одноразовые из латекса по ГОСТ Р 52239;
- контейнеры для сброса использованных наконечников и пробирок.
6.3 Для выделения (экстракции) ДНК применяют:
- бокс ламинарный, класс биологической безопасности II, тип А;
- термостат твердотельный для микропробирок, рассчитанный на температуру от 25 °C до 100 °C;
- отсасыватель медицинский вакуумный с колбой-ловушкой для удаления надосадочной жидкости;
- микроцентрифугу для микропробирок со скоростью вращения до 16000 об/мин;
- растворы дезинфицирующие, вызывающие деградацию ДНК;
- спирт этиловый ректификованный по ГОСТ 5962;
- комплект реагентов для выделения ДНК:
раствор лизирующий (48%-ный гуанидин тиоцианат, Трис-HCl молярной концентрации 0,01 моль/дм3, ЭДТА молярной концентрации 0,0125 моль/дм3, 0,5%-ный Тритон X-100, деионизованная вода);
раствор для отмывки 1 (хлорид натрия молярной концентрации 1 моль/дм3, Трис-HCl молярной концентрации 0,2 моль/дм3, ЭДТА молярной концентрации 0,02 моль/дм3, 0,1%-ный азид натрия, деионизованная вода);
раствор для отмывки 2 (хлорид натрия молярной концентрации 0,25 моль/дм3, Трис-HCl молярной концентрации 0,05 моль/дм3, ЭДТА молярной концентрации 0,005 моль/дм3, 0,025%-ный азид натрия, 48%-ный этиловый спирт, деионизованная вода);
сорбент универсальный (25%-ная взвесь частиц SiO2 размером от 20 до 50 мкм в растворе Трис-HCl молярной концентрации 0,005 моль/дм3);
ТЕ-буфер для элюции ДНК (Трис-HCl молярной концентрации 0,01 моль/дм3, ЭДТА молярной концентрации 0,001 моль/дм3);
раствор натрия хлорида 0,9%-ный изотонический.
6.4 Для проведения амплификации ДНК применяют:
- ПЦР-бокс или бокс ламинарный;
- амплификатор для микропробирок вместимостью 0,5 см3 и для микропробирок вместимостью 0,2 см3;
- ПЦР-смесь-1, содержащую дНТФ молярной концентрации 0,088 моль/мм3, праймеры F1 и R1 молярной концентрации 2 пмоль/мм3 со следующей нуклеотидной последовательностью:
F1 5'-GGTAATACATAGGTTGCAAGCGTTATCCG-3';
R1 5'-CCATGCACCATCTGTCACTCTGTTA(A/G)CCTC-3';
- масло вазелиновое медицинское по ГОСТ 3164;
- ПКО;
- ПЦР-смесь-2, содержащую ПЦР-буфер, ксиленцианол (краситель голубого цвета), MgCl2 молярной концентрации 0,0075 моль/дм3, фермент Taq-полимеразу концентрации 0,1 ед./мм3;
- ТЕ-буфер;
- воск для ПЦР.
6.5 Для детекции продуктов ПЦР-амплификации методом электрофореза в агарозном геле применяют:
- камеру для горизонтального электрофореза вместимостью не более 600 см3, укомплектованную рамкой для геля, гребенками и столиком для заливки геля;
- источник питания для горизонтального электрофореза с напряжением от 150 до 460 В;
- трансиллюминатор ультрафиолетовый с кабинетом для просмотра гелей;
- видеосистему с цифровой видеокамерой для регистрации результатов и передачи изображения;
- весы 2 класса точности по ГОСТ OIML R 76-1 со следующими характеристиками: действительная цена деления d <= 0,01 г при взвешивании в диапазоне от 0,02 г до 50 г; предел допускаемой погрешности при первичной поверке +/- 4 мг, предел допускаемой погрешности при эксплуатации +/- 5 мг;
- воду дистиллированную по ГОСТ 6709;
- печь микроволновую, соответствующую требованиям ГОСТ IEC 60335-2-25 для плавления агарозы;
- колбу коническую вместимостью 250 см3 из термостойкого стекла по ГОСТ 21400;
- емкость пластиковую вместимостью 5 дм3 для дезактивации буфера и гелей, содержащих бромид этидия;
- цилиндр мерный вместимостью 0,5 дм3 по ГОСТ 1770;
- - ТБЕ-буфер для электрофореза (концентрированный буферный раствор, содержащий трис-основание молярной концентрации 0,89 моль/дм3, борную кислоту молярной концентрации 0,89 моль/дм3, ЭДТА молярной концентрации 0,02 моль/дм3, pH = 8,3 ед. pH);
- агарозу для электрофореза;
- раствор бромистого этидия 10 мг/см3, х.ч.;
- маркер молекулярных масс ДНК, содержащий фрагменты ДНК размером от 100 до 1000 п. н.
6.6. При приготовлении реагентов должны быть соблюдены требования ГОСТ 27025.
6.7. Допускается использование других средств измерений, оборудования, материалов, посуды и реагентов с метрологическими и техническими характеристиками не ниже указанных выше.
7. Отбор, транспортирование и подготовка проб
7.1. При отборе проб, а также при их подготовке для исследования соблюдают меры, предупреждающие обсеменение объектов внешней среды.
7.2 Отбор проб проводят по ГОСТ 31929.
7.3 Отобранная лабораторная проба должна быть репрезентативной.
7.4. Транспортирование проб осуществляют при температуре, рекомендованной для хранения производителем.
7.5. Сыворотки и жидкие вакцины используют для выделения ДНК без предварительной подготовки, а пробы сухих вакцин готовят следующим образом: в ампулы (флаконы) с сухой вакциной вносят 0,9%-ный изотонический раствор хлорида натрия или дистиллированную воду по ГОСТ 6709 в объеме, соответствующем объему вакцины до высушивания. После этого ампулы (флаконы) осторожно взбалтывают и отбирают 1 см3 пробы в одноразовую микропробирку вместимостью 1,5 см3.
8. Экстракция ДНК
8.1. Лизирующий раствор и раствор для отмывки 1, содержащие кристаллы, прогревают до их полного растворения.
8.2. Готовят необходимое количество одноразовых пробирок (по числу исследуемых проб) и добавляют еще одну пробирку для отрицательного контроля экстракции и одну пробирку для положительного контроля экстракции. Вносят в каждую пробирку по 300 мм3 лизирующего раствора. Пробирки маркируют.
8.3. В пробирки с лизирующим раствором вносят по 100 мм3 исследуемой пробы, используя наконечники с аэрозольным барьером.
8.4. В пробирку отрицательного контроля экстракции ОК вносят 100 мм3 ОКО. В пробирку положительного контроля экстракции ПК вносят 90 мм3 ОКО и 10 мм3 ПКО. Если пробы готовили с использованием 0,9%-ного раствора натрия хлорида, то готовят еще один отрицательный контроль: в пробирку с лизирующим раствором вносят 50 мм3 0,9%-ного раствора натрия хлорида и 50 мм3 ОКО.
8.5. Содержимое пробирок тщательно перемешивают на встряхивателе и прогревают в течение 5 мин при температуре 65 °C. После этого пробирки центрифугируют в течение 5 с при 5000 об/мин на микроцентрифуге.
8.6. В каждую пробирку отдельным наконечником добавляют по 25 мм3 ресуспензированного на встряхивателе универсального сорбента. Содержимое пробирок тщательно перемешивают на встряхивателе, ставят в штатив на 2 мин, еще раз перемешивают и оставляют в штативе на 5 мин.
8.7. Осаждают универсальный сорбент в пробирках центрифугированием при 5000 об/мин в течение 30 с. Удаляют надосадочную жидкость, используя вакуумный отсасыватель с колбой ловушкой и отдельный наконечник для каждой пробы.
8.8. Добавляют в пробирки по 300 мм3 раствора для отмывки 1. Перемешивают на встряхивателе до полного ресуспензирования универсального сорбента. Сорбент осаждают центрифугированием при 5000 об/мин на микроцентрифуге в течение 30 с. Удаляют надосадочную жидкость в соответствии с 8.7.
8.9. Добавляют в пробирки по 500 мм3 раствора для отмывки 2, перемешивают до полного ресуспензирования сорбента, центрифугируют в течение 30 с при 10000 об/мин на микроцентрифуге. Удаляют надосадочную жидкость по 8.7.
8.10 Повторяют процедуру отмывки раствором для отмывки 2 по 8.9.
8.11. Для подсушивания универсального сорбента пробирки после отмывки по 8.10 помещают в термостат при температуре 65 °C на 5 — 10 мин. При этом крышки пробирок оставляют открытыми.
8.12. В пробирки добавляют по 50 мм3 ТЕ-буфера для элюции ДНК. Перемешивают на встряхивателе. Помещают в термостат при температуре 65 °C на 5 мин, периодически встряхивая.
8.13. Центрифугируют пробирки на максимальных оборотах микроцентрифуги в течение 1 мин. Надосадочная жидкость содержит очищенную ДНК.
8.14. При использовании других готовых наборов реагентов выделение ДНК проводят согласно инструкции по их применению.
9. Постановка ПЦР
9.1. В микропробирки вместимостью 0,5 см3 для ПЦР вносят по 5 мм3 ПЦР-смеси-1, наслаивают сверху по 10 мм3 расплавленного воска для ПЦР так, чтобы он полностью накрыл жидкость, закрывают крышки. Если воск для ПЦР покрыл жидкость неровно или образовались пузыри, прогревают пробирки в амплификаторе в течение 2 мин при температуре 95 °C и охлаждают.
Срок хранения готовой ПЦР-смеси-1 под воском при температуре минус 20 °C — не более 6 мес.
9.2. На поверхность воска вносят по 10 мм3 ПЦР-смеси-2, при этом она не должна проваливаться под воск и смешиваться с ПЦР-смесью-1.
9.3 Сверху добавляют по капле вазелинового масла (примерно 25 мм3).
При использовании амплификатора с термостатируемой крышкой вазелиновое масло не добавляют.
9.4. Под масло или непосредственно на него вносят по 10 мм3 надосадочной жидкости по 8.13, используя наконечники с аэрозольными барьерами.
Ставят контрольные реакции амплификации:
- отрицательный контроль (К-). В пробирку вместо надосадочной жидкости по 8.13 вносят 10 мм3 ТЕ-буфера;
- положительный контроль (К+). В пробирку вместо надосадочной жидкости по 8.13 вносят 10 мм3 ПКО.
9.5. Перед постановкой пробирок в амплификатор осаждают капли с их стенок кратким центрифугированием в течение 1 — 3 с.
9.6. Пробирки с надосадочной жидкостью, отрицательным и положительным контролями после центрифугирования ставят в амплификатор и запускают соответствующую программу.
При использовании ПЦР-смеси-1 с праймерами F1 и R1 с нуклеотидной последовательностью по 6.4 запускают на амплификаторе программу, представленную в таблице 1.
| Цикл | Температура | Время | Циклы |
| 0 | 95 °C | Пауза | |
| 1 | 95 °C | 2 мин | 1 |
| 2 | 95 °C | 10 с | 41 |
| 61 °C | 10 с | ||
| 72 °C | 10 с | ||
| 3 | 72 °C | 1 мин | 1 |
| 4 | 4 °C | Хранение в амплификаторе | |
9.7. После окончания программы собирают пробирки в штатив и отправляют для детекции продуктов ПЦР.
9.8. Срок хранения проб после амплификации при комнатной температуре — не более 16 ч, при температуре от 2 °C до 8 °C — не более одной недели, при температуре не более минус 16 °C — не ограничен.
10. Детекция продуктов ПЦР-амплификации методом электрофореза в агарозном геле
10.1 Приготовление рабочих растворов и агарозного геля
10.1.1. Готовят рабочий электрофорезный буфер: в мерный цилиндр вливают 50 см3 ТБЕ-буфера, доводят дистиллированной водой до 500 см3 и перемешивают.
10.1.2. 1,7 г агарозы для электрофореза ДНК помещают в стеклянную колбу из термостойкого стекла вместимостью 250 см3. Наливают 100 см3 рабочего электрофорезного буфера по 10.1.1, перемешивают вращением колбы и плавят в микроволновой печи до полного растворения агарозы. Время плавления агарозы в микроволновой печи мощностью 800 Вт при ее загруженности одной колбой — 1,5 мин.
10.1.3. Вынимают колбу с расплавленной агарозой из микроволновой печи, аккуратно перемешивают, вращая колбу.
10.1.4. После этого вновь помещают колбу с агарозой в микроволновую печь на 1,5 мин (при мощности 800 Вт), доводят агарозу до кипения.
10.1.5. Вынимают колбу из микроволновой печи и остужают агарозу до температуры 65 °C — 70 °C, вращая колбу.
10.1.6. К раствору агарозы, полученному по 10.1.5, добавляют 0,005 см3 раствора бромистого этидия концентрацией 10 мг/см3, тщательно перемешивают раствор. Полученный агарозный гель используют для заливки в рамку камеры.
10.1.7. Выравнивают столик для заливки гелей, заливают агарозный гель, полученный по 10.1.6, в рамку камеры.
10.1.8. Устанавливают гребенки, не касаясь дна рамки камеры, на расстоянии не менее 3 см друг от друга. Толщина агарозного геля должна быть около 0,6 см.
10.1.9. После полного застывания агарозного геля (30 мин при комнатной температуре), осторожно вынимают из него гребенки, не повредив лунки. Помещают рамку с готовым агарозным гелем в камеру так, чтобы лунки располагались ближе к отрицательному электроду. Заливают в камеру рабочий электрофорезный буфер по 10.1.1 так, чтобы он покрыл агарозный гель на 5 мм сверху.
10.2 Проведение электрофореза
10.2.1. Из пробирок с продуктами амплификации по 9.7 отбирают по 10 — 15 мм3 исследуемых проб и вносят в лунки агарозного геля (если для нанесения разных проб используют один и тот же наконечник, то его промывают буфером по 10.1.1 после нанесения каждой пробы). В каждом ряду лунок агарозного геля должен быть обязательно представлен К+.
10.2.2. Подключают камеру к источнику тока, соблюдая полярность (ДНК должна двигаться в направлении положительного электрода). Электрофорез проводят при напряжении от 180 до 250 В в течение 20 — 30 мин, при этом краситель ксиленцианол, входящий в ПЦР-смесь-2, должен продвинуться не менее чем на 1,5 см от старта. Оптимальная напряженность электрического поля при этом составляет 10 В/см.
10.2.3. По завершении времени электрофореза выключают источник тока, переносят рамку с гелем на трансиллюминатор, расположив полосы горизонтально лунками вверх. Получают изображение агарозного геля (электрофореграмму) на компьютере с помощью видеосистемы.
11. Учет результатов ПЦР
11.1. Учет результатов ПЦР проводят по наличию или отсутствию на электрофореграмме специфической полосы амплифицированной ДНК.
Длина амплифицированного специфического фрагмента ДНК для праймеров, указанных в 6.4, составляет 509 п. н.
11.2. Учет результатов ПЦР-анализа начинают с анализа результатов амплификации положительных и отрицательных контрольных образцов. Режим анализа приведен в таблице 2.
11.3. В дорожках агарозного геля, соответствующих лункам, содержащим положительные контроли (ПК и К+), должны быть яркие специфические светящиеся полосы на уровне 509 п. н.
11.4. В дорожках агарозного геля, соответствующих лункам, содержащим отрицательные контроли (ОК и К-), не должно быть никаких полос, за исключением возможных праймер-димеров, находящихся ниже уровня 100 п. н.
11.5. Положительными считают пробы, которые содержат специфическую светящуюся полосу на уровне 509 п. н. большей или меньшей интенсивности.
11.6. Отрицательными считают пробы, которые не содержат полосу на уровне 509 п. н.
11.7 Результаты анализа не подлежат учету, если на электрофореграмме:
- в дорожках агарозного геля, соответствующих лункам, содержащим положительные контроли (ПК и К+), отсутствует специфическая полоса на уровне 509 п. н., что может указывать на ошибку в подготовке реактивов, постановке ПЦР или сбой программы амплификатора;
- в дорожках агарозного геля, соответствующих лункам, содержащим отрицательные контроли (ОК и К-), появляется специфическая полоса на уровне 509 п. н., что может указывать на контаминацию реактивов или проб. В этом случае анализ проб повторяют с первого этапа (экстракции ДНК), а также принимают меры по выявлению источника контаминации;
- в дорожках агарозного геля появляются неспецифические полосы на разных уровнях, что может указывать на неверный температурный режим в ячейках амплификатора.
БИБЛИОГРАФИЯ
1. МУ 1.3.2569-2009 Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I — IV групп патогенности
2. СП 1.3.2322-2008 Безопасность работы с микроорганизмами III — IV групп патогенности (опасности) и возбудителями паразитарных болезней
3. СП 1.3.3118-2013 Безопасность работы с микроорганизмами I — II групп патогенности (опасности).
------------------------------------------------------------------