---
title: "\"ГОСТ Р 72598-2026/ISO/TS 24420:2023. Национальный стандарт Российской Федерации. Биотехнология. Массовое параллельное секвенирование ДНК. Общие требования к обработке данных метагеномного секвенирования методом \"дробовика\""
number: "ГОСТ Р 72598-2026"
issuer: "Федеральное агентство по техническому регулированию и метрологии"
status: действует
canonical: "https://bukva.ai/docs/standart-gost-r-72598-2026"
---

## "ГОСТ Р 72598-2026/ISO/TS 24420:2023. Национальный стандарт Российской Федерации. Биотехнология. Массовое параллельное секвенирование ДНК. Общие требования к обработке данных метагеномного секвенирования методом "дробовика"

# "ГОСТ Р 72598-2026/ISO/TS 24420:2023. Национальный стандарт Российской Федерации. Биотехнология. Массовое параллельное секвенирование ДНК. Общие требования к обработке данных метагеномного секвенирования методом "дробовика"

(утв. и введен в действие Приказом Росстандарта от 20.03.2026 N 261-ст)

> [!IMPORTANT]
> Документ [введен](#p100010) в действие с 01.09.2026.


<div align="right">

<a id="p100001"></a>Утвержден и введен в действие<br>
Приказом Федерального агентства<br>
по техническому регулированию<br>
и метрологии

</div>

<div align="center">

**от 20 марта 2026 г. N 261-ст**

<a id="p100002"></a>**НАЦИОНАЛЬНЫЙ СТАНДАРТ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ**

<a id="p100003"></a>**БИОТЕХНОЛОГИЯ**

<a id="p100004"></a>**МАССОВОЕ ПАРАЛЛЕЛЬНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ ДНК**

<a id="p100005"></a>**ОБЩИЕ ТРЕБОВАНИЯ К ОБРАБОТКЕ ДАННЫХ МЕТАГЕНОМНОГО**<br>
**СЕКВЕНИРОВАНИЯ МЕТОДОМ "ДРОБОВИКА"**

<a id="p100006"></a>**Biotechnology. Massively parallel**<br>
**DNA sequencing. General requirements for data**<br>
**processing of shotgun metagenomic sequences**

<a id="p100007"></a>**(ISO/TS 24420:2023, IDT)**

</div>


<div align="right">

<a id="p100008"></a>ГОСТ Р 72598-2026/ISO/TS 24420:2023

<a id="p100009"></a>ОКС 07.080

</div>


<a id="p100010"></a>Дата введения

<div align="center">

**1 сентября 2026 года**

</div>



### <a id="p100011"></a>Предисловие


<a id="p100012"></a>1 ПОДГОТОВЛЕН Федеральным государственным бюджетным учреждением "Российский институт стандартизации" (ФГБУ "Институт стандартизации") на основе собственного перевода на русский язык англоязычной версии документа, указанного в [пункте 4](#p100015)
<a id="p100013"></a>2 ВНЕСЕН Техническим комитетом по стандартизации ТК 326 "Биотехнологии"
<a id="p100014"></a>3 УТВЕРЖДЕН И ВВЕДЕН В ДЕЙСТВИЕ Приказом Федерального агентства по техническому регулированию и метрологии от 20 марта 2026 г. N 261-ст
<a id="p100015"></a>4 Настоящий стандарт идентичен международному документу ISO/TS 24420:2023 "Биотехнология. Массовое параллельное секвенирование ДНК. Общие требования к обработке данных метагеномного секвенирования методом "дробовика" (ISO/TS 24420:2023 "Biotechnology - Massively parallel DNA sequencing - General requirements for data processing of shotgun metagenomic sequences", IDT).
<a id="p100016"></a>При применении настоящего стандарта рекомендуется использовать вместо ссылочного международного стандарта соответствующий ему национальный стандарт, сведения о котором приведены в дополнительном [приложении ДА](#p100517)

<div align="center">

<a id="p100017"></a>**5 ВВЕДЕН ВПЕРВЫЕ**

</div>

<a id="p100018"></a>6 Некоторые положения международного документа, указанного в [пункте 4](#p100015), могут являться объектом патентных прав. Международная организация по стандартизации (ИСО) не несет ответственности за идентификацию подобных патентных прав

<a id="p100019"></a>Правила применения настоящего стандарта установлены в статье 26 Федерального закона от 29 июня 2015 г. N 162-ФЗ "О стандартизации в Российской Федерации". Информация об изменениях к настоящему стандарту публикуется в ежегодном (по состоянию на 1 января текущего года) информационном указателе "Национальные стандарты", а официальный текст изменений и поправок - в ежемесячном информационном указателе "Национальные стандарты". В случае пересмотра (замены) или отмены настоящего стандарта соответствующее уведомление будет опубликовано в ближайшем выпуске ежемесячного информационного указателя "Национальные стандарты". Соответствующая информация, уведомление и тексты размещаются также в информационной системе общего пользования - на официальном сайте Федерального агентства по техническому регулированию и метрологии в сети Интернет (www.rst.gov.ru)


### <a id="p100020"></a>Введение


<a id="p100021"></a>Метагеномное секвенирование методом "дробовика" геномов организмов из сложного образца широко используется в науках о жизни, а также в области клинических исследований (например, анализ сложных заболеваний человека, микроэкология окружающей среды и другие области) с целью получения знаний об их составе и функциях. Данный метод может предоставить важные научные данные для исследований в области естественных наук.
<a id="p100022"></a>Преимуществом данного метода является его способность выявлять микробное разнообразие и распространенность, обнаруженные в микробных популяциях из различных сред, и определять информацию о последовательности (таксономическая характеристика, функциональная аннотация и сравнительный анализ/метагеномика) для отдельных организмов в этих популяциях. Полученные данные могут быть подвергнуты сравнительному анализу. Массово-параллельное метагеномное секвенирование методом "дробовика" генерирует большой объем данных, содержащих высокую сложность микробных геномов и большое количество неизвестных видов. Важно использовать эффективные процедуры обработки и инструменты контроля качества для данных метагеномного секвенирования методом "дробовика". Стандартизированный формат данных необходим для содействия обмену данными.
<a id="p100023"></a>Как и любая передовая технология, технологии массового параллельного секвенирования подвержены ошибкам. Важно преодолеть эти недостатки, чтобы обеспечить надежный результат секвенирования и анализа. Настоящий стандарт содержит единые требования для сопоставления, хранения и последующего анализа метагеномных данных, а также руководящие принципы. Он содержит требования и рекомендации для рабочего процесса и процесса метагеномного анализа методом "дробовика", включая контроль качества данных секвенирования и метаданных, а также композиционный и функциональный анализ микробного сообщества. Эти требования и рекомендации могут обеспечить точность данных, полученных в результате метагеномного анализа, устранить потенциальные ошибки и облегчить последующее применение.


### <a id="p100024"></a>1 Область применения


<a id="p100025"></a>**В настоящем стандарте представлен рабочий процесс обработки данных метагеномного секвенирования методом "дробовика" микробиома, полученного от хозяина, и метагеномов окружающей среды.**
<a id="p100026"></a>Настоящий стандарт устанавливает требования к контролю качества обработки данных метагеномного секвенирования методом "дробовика" для массового параллельного секвенирования ДНК.
<a id="p100027"></a>Настоящий стандарт содержит рекомендации по каталогу данных, архиву данных и метаданным для данных метагеномного секвенирования методом "дробовика".
<a id="p100028"></a>**Настоящий стандарт также рассматривает аспекты, связанные с хранением данных, обменом данными и взаимодействием данных метагеномного секвенирования методом "дробовика".**
<a id="p100029"></a>В настоящем стандарте рассматриваются вопросы обработки и анализа данных метагеномного секвенирования методом "дробовика", но исключается их функциональный анализ.


### <a id="p100030"></a>2 Нормативные ссылки


<a id="p100031"></a>В настоящем стандарте использована нормативная ссылка на следующий стандарт [для датированной ссылки применяют только указанное издание ссылочного стандарта, для недатированных - последнее (включая все изменения)]:
<a id="p100032"></a>ISO 20397-1:2022, Biotechnology - Massively parallel sequencing - Part 1: Nucleic acid and library preparation (Биотехнология. Массовое параллельное секвенирование. Часть 1. Подготовка нуклеиновой кислоты и библиотеки)


### <a id="p100033"></a>3 Термины и определения


<a id="p100034"></a>В настоящем стандарте применены следующие термины с соответствующими определениями.
<a id="p100035"></a>ИСО и МЭК поддерживают терминологические базы данных, используемые в стандартизации по следующим адресам:
- <a id="p100036"></a>платформа онлайн-просмотра ИСО: доступна по адресу https://www.iso.org/obp
- <a id="p100037"></a>Электропедия МЭК: доступна по адресу http://www.electropedia.org/
<a id="p100038"></a>3.1 значение атрибута (attribute value): Значение, связанное с экземпляром атрибута.
<a id="p100039"></a>[ИСО 21962:2003, 1.5.2.3]
<a id="p100040"></a>3.2 категория (category): Набор элементов или концепций, которые имеют общий атрибут или функцию.
<a id="p100041"></a>3.3 классификация (classification): Исчерпывающий набор взаимоисключающих категорий для агрегации данных на заранее заданном уровне специализации для определенной цели.
<a id="p100042"></a>[ИСО 17115:2007, 2.7.1]
<a id="p100043"></a>3.4 очищенные данные (clean data): Секвенированные данные, полученные после процедуры предварительной обработки, которая обычно включает несколько этапов обрезки и фильтрации для обеспечения определенных уровней качества (например, базовое качество, последовательности хозяина/контаминанты удалены, линкеры/адаптеры удалены).
<a id="p100044"></a>3.5 код (code): Система правил для преобразования информации, такой как текст, изображения, звуки или электрические, фотонные или магнитные сигналы, в другую форму или представление для облегчения анализа, связи или хранения на носителе данных.
<a id="p100045"></a>[ИСО 20691:2022, 3.6]
<a id="p100046"></a>3.6 кодирование (encoding): Процесс присвоения кода объектам или концепциям.
<a id="p100047"></a>3.7 контиг (contig): Непрерывная последовательность ДНК, созданная путем сборки перекрывающихся секвенированных фрагментов хромосомы или плазмиды.
<a id="p100048"></a>3.8 формат данных (data format): Организация данных в соответствии с заданными требованиями.
<a id="p100049"></a>Примечание 1 - Заданные требования обычно создаются для компьютерной обработки.

<a id="p100050"></a>3.9 элемент данных (data element): Одна единица данных, которая в определенном контексте считается неделимой.
<a id="p100051"></a>[ISO/TS 21089:2018, 3.44]
<a id="p100052"></a>3.10 каталог (directory): Список элементов данных, который дает детализированную информацию, позволяющую отслеживать, идентифицировать и находить связанные данные.
<a id="p100053"></a>Примечание 1 - Каталог может быть организован в алфавитном, хронологическом или систематическом порядке.

<a id="p100054"></a>3.11 идентификатор каталога (directory identifier): Уникальный независимый от языка знак, присвоенный архивному каталогу в структуре.
<a id="p100055"></a>3.12 ген (gene): Последовательность нуклеотидов в ДНК или РНК, кодирующая РНК либо белковый продукт.
<a id="p100056"></a>Примечания
<a id="p100057"></a>1 Гены признаются основной единицей наследственности.
<a id="p100058"></a>2 Ген может состоять из несмежных сегментов нуклеиновой кислоты, которые перестраиваются на этапе обработки ядра.
<a id="p100059"></a>3 Ген может включать или быть частью оперона, который содержит элементы для экспрессии гена.

<a id="p100060"></a>[ИСО 20397-2:2021, 3.16]
<a id="p100061"></a>3.13 идентификатор (identifier): Последовательность символов, способная однозначно идентифицировать то, с чем она связана, в указанном контексте.

<div align="center">

<a id="p100062"></a>[ИСО/МЭК 11179-1:2015, 3.1.3]

</div>

<a id="p100063"></a>*3.14 аналитические данные (analytical data): Набор элементов для описания качественных или количественных аналитических атрибутов обработанных метагеномных исходных данных.*
<a id="p100064"></a>*3.15 имя (name): Семантические, естественно-языковые метки, присваиваемые элементам данных, и вариации этих меток, выполняющие различные функции*
<a id="p100065"></a>*[ИСО/МЭК 11179-1:2015, 3.43]*
<a id="p100066"></a>*3.16 публичный атрибут (public attribute): Атрибут, который может иметь одинаковое значение атрибута для разных данных в каталоге*
<a id="p100067"></a>*3.17 показатель качества, показатель Q (quality score, Q score, Phred score, quality of base calling): Мера вероятности правильного распознавания оснований, обычно выражаемая непосредственно числовым значением.*
<a id="p100068"></a>*Примечания*
<a id="p100069"></a>*1 Показатель Q определяют по формуле*

<a id="p100070"></a>*Q = -10log10(p),*

<a id="p100071"></a>где p - предполагаемая вероятность того, что расшифровка оснований будет неверной.
<a id="p100072"></a>2 Показатель качества, равный 20, представляет собой частоту ошибок 1 из 100 с соответствующей точностью расшифровки 99%.
<a id="p100073"></a>3 Показатель качества, равный 30, представляет собой частоту ошибок 1 из 1 000 с соответствующей точностью расшифровки 99,9%.
<a id="p100074"></a>4 Более высокие показатели качества указывают на меньшую вероятность ошибки. Более низкие показатели качества могут привести к тому, что значительная часть прочтений окажется непригодной для использования. Низкие показатели качества также могут указывать на ложноположительные варианты расшифровок, что приводит к неточным выводам.

<a id="p100075"></a>3.18 исходные данные (raw data): Первичные данные секвенирования, полученные секвенатором без использования какой-либо предварительной фильтрации на основе программного обеспечения для целей анализа.
<a id="p100076"></a>[ИСО 20397-2:2021, 3.21]
<a id="p100077"></a>3.19 относительная распространенность (relative abundance): Доля одного микроорганизма, операционной таксономической единицы в общем микробном сообществе определенной среды.
<a id="p100078"></a>Примечание - Обычно представлена в процентах.

<a id="p100079"></a>3.20 требование повторяемости (repeatability requirement): Требование согласованности при наборе повторяемых условий измерения.
<a id="p100080"></a>3.21 скаффолд (scaffold): Реконструированная геномная последовательность, созданная путем объединения контигов вместе с использованием дополнительной информации об относительном положении и ориентации контигов в геноме.
<a id="p100081"></a>3.22 сборка последовательности (sequence assembly): Обработка, выравнивание и объединение отдельных прочтений секвенирования с целью реконструкции более длинных последовательностей ДНК, целых генов или геномов.
<a id="p100082"></a>Примечание - К словарной статье: При секвенировании нового генома, где нет референсной последовательности, доступной для выравнивания, прочтения последовательности собираются как контиги, то есть сборка de-novo.

<a id="p100083"></a>3.23 метагеномное секвенирование методом "дробовика" (shotgun metagenomics sequencing, shotgun metagenomics): Определение последовательности нуклеотидов геномов нецелевых клеток в сообществах с целью определения состава и функции сообщества.
<a id="p100084"></a>Примечания
<a id="p100085"></a>1 Для микробиома метагеномика методом "дробовика" фокусируется на микробных сообществах в определенных средах.
<a id="p100086"></a>2 Для метагеномного секвенирования методом "дробовика" ДНК извлекается из микробов в образце напрямую без изоляции и культивирования. Затем эта ДНК используется для анализа генетического состава, классификации видов, филогении, функции гена или метаболической сети, или их комбинаций.

<a id="p100087"></a>3.24 специализированный атрибут (specialized attribute): Атрибут, который является уникальным для каждого образца в каталоге.


### <a id="p100088"></a>4 Процесс обработки


<a id="p100089"></a>Базовый рабочий процесс метагеномики должен включать секвенирование, обработку данных и анализ данных. Обработка данных включает предварительную обработку, контроль качества, сбор данных, профилирование данных и аннотацию, как показано на [рисунке 1](#p100091).

<a id="p100090"></a> ![4 Процесс обработки](https://i.bukva.ai/3rbxVp5X/img_0.png) 

<div align="center">

<a id="p100091"></a>Рисунок 1 - Процесс обработки метагеномных данных

</div>



### <a id="p100092"></a>5 Обработка данных



#### <a id="p100093"></a>5.1 Требования к оборудованию и программному обеспечению

<a id="p100094"></a>5.1.1 Необходимо проверить программный конвейер для метагеномной биоинформатики. Приложения для конвейера должны быть заблокированы, включая полный набор инструментов, код, операционную среду и сетевые соединения, которые составляют конвейер, перед его использованием в аналитических целях, таких как оболочка (например, BASH), GNU R и Python. Изменения в любых компонентах конвейера требуют повторной проверки, чтобы гарантировать отсутствие влияния на характеристики производительности конвейера.
<a id="p100095"></a>5.1.2 Высокопроизводительные вычислительные технологии могут использоваться на любом этапе процесса для обеспечения надлежащего управления и курирования больших коллекций сложных прокариотических и эукариотических геномов, поскольку обработка массивных наборов данных является предпосылкой для аналитики метагеномики NGS.

#### <a id="p100096"></a>5.2 Контроль качества последовательности и определение ошибок

<a id="p100097"></a>5.2.1 Исходные данные метагеномного секвенирования должны первоначально пройти процесс контроля качества (КК), чтобы гарантировать чистый набор данных. Оценка должна соответствовать ИСО 20397-1:2022, раздел 4 и пункт 8.3, а также ИСО 20397-2:2021, пункт 4.3.
<a id="p100098"></a>5.2.2 Доступные значения качества данных для каждого образца ДНК после секвенирования должны соответствовать следующим требованиям:
<a id="p100099"></a>a) Q20 >= 90%, более 90% от значения исходной массы образца должно быть больше 20;
<a id="p100100"></a>b) Q30 >= 80%, более 80% от значения исходной массы образца должно быть больше 30.
<a id="p100101"></a>Вышеуказанные требования применяются только к коротким прочтениям последовательностей <= 350 п.о.
<a id="p100102"></a>5.2.3 Для образцов человека, животного или растения, или всех образцов, хостриды должны быть удалены путем сопоставления с референсом генома человека, животного или растения, таким как UniRef, Единый каталог белков желудочно-кишечного тракта человека. Только чистые данные должны использоваться в дальнейшем биоинформатическом анализе.
<a id="p100103"></a>5.2.4 Обнаружение и устранение повторов и ошибок секвенирования следует выполнять в качестве первого шага в обработке данных. В процессе устранения должны учитываться следующие факторы и ситуации:
<a id="p100104"></a>a) несоответствие, вставка или пропуск (инделы) (только при наличии референсного генома) и неопределенные основания (символы N);
<a id="p100105"></a>b) нераспознаваемая последовательность, которая может быть вызвана, если риды простираются до 3'-конца адаптера, когда целевая последовательность короче;
<a id="p100106"></a>c) смещения ПЦР при подготовке библиотеки в соответствии с ИСО 20397-1:2022, 5.8.

#### <a id="p100107"></a>5.3 Сборка последовательности

<a id="p100108"></a>5.3.1 Глубина секвенирования должна быть оценена до сборки последовательности, которая должна учитывать сложность образца.
<a id="p100109"></a>5.3.2 Образцы, не имеющие референсного набора данных генома, такие как образцы почвы или океана, должны использовать сборку последовательности.
<a id="p100110"></a>5.3.3 Контиги и/или скаффолды, которые напрямую получены из фрагментов последовательности без какой-либо ссылки, следует рассматривать как собирание de-novo.
<a id="p100111"></a>5.3.4 Выбор программного обеспечения для собирания последовательности должен зависеть от относительной важности таких параметров как точность, размер контигов, тип входных данных и доступные вычислительные ресурсы.
<a id="p100112"></a>5.3.5 Неизбыточный каталог генов может быть получен путем прогнозирования генов из собранных контигов. Для хорошо охарактеризованных микробиомов, например кишечно-инженерных, для быстрой идентификации и количественной оценки данных из метагеномного секвенирования можно использовать надежный каталог генов (например, интегрированный каталог генов (IGC)).
<a id="p100113"></a>5.3.6 Созданные сборы следует оценивать для определения их качества, например, QUAST.


### <a id="p100114"></a>6 Анализ данных



#### <a id="p100115"></a>6.1 Аннотация

<a id="p100116"></a>6.1.1 Должны быть описаны методы аннотации. Количество выбранных референсных геномов, а также референсные геномы или референсная база данных, используемые для аннотации, должны быть задокументированы.
<a id="p100117"></a>6.1.2 Методы таксономического профиля следует выбирать в соответствии с данными и потребностями приложения для получения таксономического профиля более высокого уровня (например, вида, рода, отряда, типа), включая метагеномные группы сцепления (MLG), метагеномные кластеры (MGC) или метагеномные виды (MGS).
<a id="p100118"></a>6.1.3 Профилирование таксономии должно основываться на справочных базах данных, таких как RefSeq полные геномы (RefSeq CG) для микробных видов и базы данных $BLAST^{®1}$ <1> для высококачественных последовательностей нуклеотидов и белков. Точность классификации, скорость и вычислительные требования должны быть приняты во внимание при выборе инструментов таксономической классификации.

<a id="p100119"></a>

---

<a id="p100120"></a><1> $BLAST®$ является торговой маркой продукта, поставляемого Национальным центром биотехнологической информации (США). Эта информация предоставляется для удобства пользователей настоящего стандарта и не является одобрением со стороны ИСО названного продукта. Эквивалентные продукты могут быть использованы, если можно продемонстрировать, что они приводят к тем же результатам.

<a id="p100121"></a>6.1.4 Если профиль получен методом собирания последовательности de-novo, информация о виде должна быть идентифицирована, когда определяется выравнивание со сходством последовательности более 97% и охватом более 90% наиболее связанной справочной базы данных.
<a id="p100122"></a>6.1.5 Для подходов, основанных на чтении, чтение должно выполнять сопоставление с неизбыточной базой данных последовательностей белков (NR) для данных таксономии (например, $BLAST®$ , Diamond или Last) или маркерных генов после слияния чтений.
<a id="p100123"></a>6.1.6 Метагеномные профили должны быть аннотированы на различных уровнях в соответствии с референсной аннотацией, т.е. вид, род или выше.

#### <a id="p100124"></a>6.2 Расчет относительной распространенности видов


##### <a id="p100125"></a>6.2.1 Анализ видов

<a id="p100126"></a>6.2.1.1 Метод расчета относительной распространенности должен быть определен и реализован для удовлетворения требования повторяемости. Метод расчета относительной распространенности должен быть задокументирован.
<a id="p100127"></a>6.2.1.2 Инструменты расчета должны быть выбраны с учетом отражения фактической относительной распространенности целевой операционной таксономической единицы в образце.

##### <a id="p100128"></a>6.2.2 Анализ генов

<a id="p100129"></a>6.2.2.1 Таблицу распространенности генов можно создать с помощью инструментов на основе выравнивания или методов без выравнивания.
<a id="p100130"></a>6.2.2.2 Относительное распределение распространенности на уровне генов можно получить путем сравнения очищенных данных с собранным набором генов или соответствующей справочной базой данных.
<a id="p100131"></a>6.2.2.3 Для получения рабочей таксономической единицы необходимо выполнить суперпозицию относительной распространенности последовательности генов одного и того же вида.


### <a id="p100132"></a>7 Архив данных и метаданные



#### <a id="p100133"></a>7.1 Исходные данные

<a id="p100134"></a>7.1.1 Объем данных секвенирования должен быть оценен для получения насыщенной генной информации в исследованиях ассоциаций по всему метагеному (MWAS).
<a id="p100135"></a>7.1.2 Независимо от источника образца, формат данных секвенирования должен быть одинаковым для каждой последовательности. Хранимый формат данных последовательности должен быть стандартизован, сохраняя информацию о биологических последовательностях (обычно последовательности нуклеиновых кислот) или качество их секвенирования; ИСО 20691:2022, A.2 включает информацию о форматах данных для методов OMICS, биохимии и молекулярной биологии.

#### <a id="p100136"></a>7.2 Аналитические данные секвенирования

<a id="p100137"></a>7.2.1 Аналитические данные секвенирования должны включать количество прочтений, общую относительную распространенность рода, общую относительную распространенность функции и общую относительную распространенность вида.
<a id="p100138"></a>7.2.2 Аналитические данные секвенирования должны быть отформатированы в виде текста и содержать заголовок и строки данных (примеры приведены в [приложении A](#p100158)), такие как общая относительная распространенность рода (см. [таблицу A.1](#p100178)), общая относительная распространенность вида (см. [таблицу A.2](#p100216)), индекс бактериального разнообразия (см. [таблицу A.3](#p100252)), индекс энтеротипов (см. [таблицу A.4](#p100281)), относительная распространенность бактерий (см. [таблицу A.5](#p100310)), общая относительная распространенность генов (см. [таблицу A.6](#p100348)). Рекомендуется сжатый формат, например GZ или Zstd.

#### <a id="p100139"></a>7.3 Каталог данных и архив


##### <a id="p100140"></a>7.3.1 Общие положения

<a id="p100141"></a>Описание данных и метаданные должны соответствовать ИСО 20691:2022, раздел 4 и раздел 5.

##### <a id="p100142"></a>7.3.2 Каталог элементов данных

<a id="p100143"></a>7.3.2.1 Каталог элементов данных должен включать общедоступные атрибуты и специализированные атрибуты.
<a id="p100144"></a>7.3.2.2 Публичные атрибуты такие же, как и другие геномные данные, требующие следующих записей: версия, орган регистрации, режим классификации, ответственная организация и организация-отправитель.
<a id="p100145"></a>7.3.2.3 Специализированные атрибуты должны включать информацию о секвенировании, информацию о биологическом анализе, метагеномную информацию и информацию о контроле качества. Примеры каждого атрибута приведены в приложении B (см. [таблицы B.1](#p100370), [B.2](#p100429) и [B.3](#p100449)).

##### <a id="p100146"></a>7.3.3 Архивирование данных

<a id="p100147"></a>Каталог метагеномных данных может быть разделен на исходный каталог данных и каталог результатов анализа. Оба должны быть многоуровневыми каталогами. Каждый уровень каталога должен включать идентификатор каталога, имя каталога, определение каталога и родительский каталог.

#### <a id="p100148"></a>7.4 Метаданные

<a id="p100149"></a>7.4.1 Метаданные могут структурно храниться в виде плоского файла данных во время обработки данных, включая фенотипическую информацию, информацию о контроле качества, преаналитическую информацию (метод сбора, использование стабилизатора(ов), задержки между сбором и обработкой, временные условия хранения, метод выделения ДНК и параметры метода, а кроме того метод контроля качества ДНК и результаты) и т.д.
<a id="p100150"></a>7.4.2 Должна быть проведена проверка согласованности метаданных и данных секвенирования, чтобы проверить, соответствуют ли образцы данных секвенирования образцам, описанным метаданными, например пропуски данных, дублирования, сопоставление ошибок и маркировка ошибок.
<a id="p100151"></a>7.4.3 Каталог метагеномных метаданных должен включать каталог информации о последовательностях, биоинформатический аналитический каталог и метагеномный каталог. Эти каталоги должны включать следующую информацию:
<a id="p100152"></a>a) каталог информации о последовательностях должен включать метаданные, описывающие ход секвенирования, такие как имя списка задач секвенирования, тип секвенирования, имя платформы секвенирования, идентификаторы секвенатора, имя секвенатора и номер чипа;
<a id="p100153"></a>b) биоинформационный аналитический каталог должен включать метаданные, описывающие программное обеспечение для биоинформатического анализа, например версию и параметры;
<a id="p100154"></a>c) метагеномный каталог должен включать метаданные, описывающие процесс и результаты метагеномного анализа, например код, имя, значение, длину, описание целостности, тип, род, вид и тип кишечника.
<a id="p100155"></a>7.4.4 Данные секвенирования должны иметь метаданные для обеспечения прослеживаемости и целостности информации об образце. Информация о метаданных может соответствовать "Минимальной информации о последовательности генома (MIGS)" и "Минимальной информации о последовательности метагенома (MIMS)" [[7]](#p100546).
<a id="p100156"></a>7.4.5 Должна быть проведена проверка для сохранения соответствия между метаданными и данными секвенирования.





<a id="p100157"></a>Приложение A
(справочное)

<a id="p100158"></a>ПРИМЕРЫ ФОРМАТОВ ДАННЫХ

<div align="right">

<a id="p100159"></a>A.1 Общая относительная распространенность рода<br>
<a id="p100160"></a>A.1.1 Общие положения

</div>

<a id="p100161"></a>Данные могут быть в текстовом формате и отображаться со строкой заголовка и строкой данных. Общая информация об относительном распространении рода в метагеномике содержится в строке данных.

<div align="center">

<a id="p100162"></a>**A.1.2 Строка заголовка**

</div>

<a id="p100163"></a>Строка заголовка имеет N + 2 (N - количество референсных образцов) фиксированных полей, каждое поле связано с помощью табуляции, как показано ниже:
<a id="p100164"></a>[1]. # Научное_название
<a id="p100165"></a>[2]. значение_относительной_распространенности_образца
<a id="p100166"></a>[3]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_1
<a id="p100167"></a>......
<a id="p100168"></a>[N]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_N
<a id="p100169"></a>A.1.3 Строка данных
<a id="p100170"></a>Каждая строка имеет N + 2 (N - количество референсных образцов) фиксированных полей, каждое поле связано с помощью табуляции, а нулевое значение каждого поля использует точку "." для представления. Соответствующая информация о поле выглядит следующим образом.
<a id="p100171"></a>[1]. научное_название: Название рода бактерий, тип строки и использование базы данных NCBI Taxonomy для описания, см. в https://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy.
<a id="p100172"></a>[2]. значение_относительной_распространенности_образца: Общие значения относительной распространенности рода образца, показаны в виде десятичной дроби.
<a id="p100173"></a>[3]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_1: Общие значения относительной распространенности рода референсного образца 1, показаны в виде десятичной дроби.
<a id="p100174"></a>......
<a id="p100175"></a>[N]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_N: Общие значения относительной распространенности рода референсного образца N, показаны в виде десятичной дроби.
<a id="p100176"></a>A.1.4 Таблица примеров

<a id="p100177"></a>Таблица A.1

<a id="p100178"></a>Примеры общей относительной распространенности рода


| <a id="p100179"></a>Заголовок списка | <a id="p100180"></a>Пример 1 | <a id="p100181"></a>Пример 2 |
| --- | --- | --- |
| <a id="p100182"></a># научное_название | <a id="p100183"></a>Abiotrophia | <a id="p100184"></a>Acetivibrio |
| <a id="p100185"></a>значение_относительной_распространенности_образца | <a id="p100186"></a>3,079 903e-06 | <a id="p100187"></a>4,047 342e-05 |
| <a id="p100188"></a>значение_относительной_распространенности_референсного_образца_1 | <a id="p100189"></a>3,227 675e-06 | <a id="p100190"></a>1,407 130e-05 |
| <a id="p100191"></a>...... | <a id="p100192"></a>...... | <a id="p100193"></a>...... |
| <a id="p100194"></a>значение_относительной_распространенности_референсного_образца_N | <a id="p100195"></a>0 | <a id="p100196"></a>4,641 824e-06 |


<a id="p100197"></a>A.2 Общая относительная распространенность видов
<a id="p100198"></a>A.2.1 Общие положения
<a id="p100199"></a>Данные могут быть в текстовом формате и отображаться со строкой заголовка и строкой данных. Общая информация об относительном обилии видов в метагеномике содержится в строке данных.
<a id="p100200"></a>A.2.2 Строка заголовка
<a id="p100201"></a>Строка заголовка имеет N + 2 (N - количество референсных образцов) фиксированных полей, каждое поле связано с вкладкой, как показано ниже:
<a id="p100202"></a>[1]. # научное_название.
<a id="p100203"></a>[2]. значение_относительной_распространенности_образца.
<a id="p100204"></a>[3]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_1.
<a id="p100205"></a>......
<a id="p100206"></a>[N]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_N.
<a id="p100207"></a>A.2.3 Строка данных
<a id="p100208"></a>Каждая строка имеет N + 2 (N - количество референсных образцов) фиксированных полей, каждое поле связано с вкладкой, а нулевое значение каждого поля использует точку "." для представления. Соответствующая информация о поле выглядит следующим образом:
<a id="p100209"></a>[1]. научное_название: Название вида бактерий, тип строки и использование базы данных таксономии NCBI для описания, см. в https://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy.
<a id="p100210"></a>[2]. значение_относительной_распространенности_образца: Общие относительные значения распространенности видов образца, показаны в виде десятичной дроби.
<a id="p100211"></a>[3]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_1: Общие значения распространенности видов референтного образца 1, показаны в виде десятичной дроби.
<a id="p100212"></a>......
<a id="p100213"></a>[N]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_N: Общие относительные значения распространенности видов референтного образца N, показаны в десятичной дроби.
<a id="p100214"></a>A.2.4 Таблица примеров

<a id="p100215"></a>Таблица A.2

<div align="right">

<a id="p100216"></a>Примеры общей относительной распространенности видов

</div>



| <a id="p100217"></a>Заголовок списка | <a id="p100218"></a>Пример 1 | <a id="p100219"></a>Пример 2 |
| --- | --- | --- |
| <a id="p100220"></a># научное_название | <a id="p100221"></a>Abiotrophia defectiva | <a id="p100222"></a>Achromobacter piechaudii |
| <a id="p100223"></a>значение_относительной_распространенности_образца | <a id="p100224"></a>1,163 749 42e-05 | <a id="p100225"></a>0 |
| <a id="p100226"></a>значение_относительной_распространенности_референсного_образца_1 | <a id="p100227"></a>3,737 392 6e-06 | <a id="p100228"></a>0 |
| <a id="p100229"></a>...... | <a id="p100230"></a>...... | <a id="p100231"></a>...... |
| <a id="p100232"></a>значение_относительной_распространенности_референсного_образца_N | <a id="p100233"></a>2,180 657e-06 | <a id="p100234"></a>1,444 14e-07 |


<a id="p100235"></a>A.3 Индекс бактериального разнообразия
<a id="p100236"></a>A.3.1 Общие положения
<a id="p100237"></a>Данные могут быть в текстовом формате и отображаться со строкой заголовка и строкой данных. Информация об индексе бактериального разнообразия в метагеномике содержится в строке данных.
<a id="p100238"></a>A.3.2 Строка заголовка
<a id="p100239"></a>Строка заголовка имеет 4 фиксированных поля, каждое поле связано с вкладкой, как показано ниже:
<a id="p100240"></a>[1]. # имя_образца.
<a id="p100241"></a>[2]. количество_генов.
<a id="p100242"></a>[3]. индекс_Шеннона.
<a id="p100243"></a>[4]. соотношение_показателей_разнообразия.
<a id="p100244"></a>A.3.3 Строка данных
<a id="p100245"></a>Каждая строка имеет четыре фиксированных поля, каждое поле соединено табуляцией, а нулевое значение каждого поля использует точку "." для представления. Соответствующая информация о полях следующая:
<a id="p100246"></a>[1]. # имя_образца: имя образца, тип строки.
<a id="p100247"></a>[2]. количество_генов: общее количество генов, округленное число.
<a id="p100248"></a>[3]. индекс_Шеннона: Индекс разнообразия Шеннона, отображается в виде десятичной дроби.
<a id="p100249"></a>[4]. соотношение_показателей_разнообразия: доля группы ниже индекса Шеннона, отображается в виде десятичной дроби, значения находятся в диапазоне от 0 до 1.
<a id="p100250"></a>A.3.4 Таблица примеров

<a id="p100251"></a>Таблица A.3

<div align="right">

<a id="p100252"></a>Примеры индекса бактериального разнообразия

</div>



| <a id="p100253"></a>Заголовок списка | <a id="p100254"></a>Пример 1 | <a id="p100255"></a>Пример 2 |
| --- | --- | --- |
| <a id="p100256"></a># имя_образца | <a id="p100257"></a>9 387 | <a id="p100258"></a>9 388 |
| <a id="p100259"></a>количество_генов | <a id="p100260"></a>769 324 | <a id="p100261"></a>844 883 |
| <a id="p100262"></a>индекс_Шеннона | <a id="p100263"></a>12,380 35 | <a id="p100264"></a>12,396 23 |
| <a id="p100265"></a>соотношение_показателей_разнообразия | <a id="p100266"></a>0,965 2 | <a id="p100267"></a>0,970 1 |


<a id="p100268"></a>A.4 Индекс энтеротипов
<a id="p100269"></a>A.4.1 Общие положения
<a id="p100270"></a>Данные могут быть в текстовом формате и отображаться со строкой заголовка и строкой данных. Информация об энтеротипах в метагеномике содержится в строке данных.
<a id="p100271"></a>A.4.2 Строка заголовка
<a id="p100272"></a>Строка заголовка имеет два фиксированных поля, каждое поле соединено табуляцией:
<a id="p100273"></a>[1]. # имя_образца.
<a id="p100274"></a>[2]. структура_кишечника.
<a id="p100275"></a>A.4.3 Строка данных
<a id="p100276"></a>Каждая строка имеет 2 фиксированных поля, каждое поле соединено табуляцией, а нулевое значение каждого поля использует точку "." для представления. Соответствующая информация о полях выглядит следующим образом:
<a id="p100277"></a>[1]. # имя_образца: имя образца, тип строки.
<a id="p100278"></a>[2]. структура_кишечника: Энтеротип, тип строки.
<a id="p100279"></a>A.4.4 Таблица примеров

<a id="p100280"></a>Таблица A.4

<div align="right">

<a id="p100281"></a>Примеры индекса Энтеротипа

</div>



| <a id="p100282"></a>Заголовок списка | <a id="p100283"></a>Пример 1 | <a id="p100284"></a>Пример 2 |
| --- | --- | --- |
| <a id="p100285"></a># имя_образца | <a id="p100286"></a>5 002 | <a id="p100287"></a>5 003 |
| <a id="p100288"></a>структура_кишечника | <a id="p100289"></a>Prevotella | <a id="p100290"></a>Bacteroides |


<a id="p100291"></a>A.5 Относительная распространенность бактерий
<a id="p100292"></a>A.5.1 Общие положения
<a id="p100293"></a>Данные могут быть в текстовом формате и показаны со строкой заголовка и строкой данных. Информация об относительном содержании бактерий в метагеномике содержится в строке данных.
<a id="p100294"></a>A.5.2 Строка заголовка
<a id="p100295"></a>Строка заголовка имеет N + 2 (N - количество референсных образцов) фиксированных полей, каждое поле связано с вкладкой, как показано ниже:
<a id="p100296"></a>[1]. # название_бактерии.
<a id="p100297"></a>[2]. значение_относительной_распространенности_образца.
<a id="p100298"></a>[3]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_1.
<a id="p100299"></a>......
<a id="p100300"></a>[N]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_N.
<a id="p100301"></a>A.5.3 Строка данных
<a id="p100302"></a>Каждая строка имеет N + 2 (N - количество референсных образцов) фиксированных полей, каждое поле соединено табуляцией, а нулевое значение каждого поля использует точку "." для представления. Соответствующая информация о поле выглядит следующим образом:
<a id="p100303"></a>[1]. НАЗВАНИЕ_БАКТЕРИИ: Название бактерий, тип строки.
<a id="p100304"></a>[2]. значение_относительной_распространенности_образца: Значения относительной распространенности рода бактерий в образце, отображаются в виде десятичной дроби.
<a id="p100305"></a>[3]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_1: Значения относительной распространенности рода бактерий в референсном 1, отображаются в виде десятичной дроби.
<a id="p100306"></a>......
<a id="p100307"></a>[N]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_N: Значения относительной распространенности рода бактерий в референсном образце N, отображаются в виде десятичной дроби.
<a id="p100308"></a>A.5.4 Таблица примеров

<a id="p100309"></a>Таблица A.5

<div align="right">

<a id="p100310"></a>Примеры относительной распространенности бактерий

</div>



| <a id="p100311"></a>Заголовок списка | <a id="p100312"></a>Пример 1 | <a id="p100313"></a>Пример 2 |
| --- | --- | --- |
| <a id="p100314"></a># название_бактерии | <a id="p100315"></a>Bacteroides uniformis | <a id="p100316"></a>Bifidobacterium adolescentis |
| <a id="p100317"></a>значение_относительной_распространенности_образца | <a id="p100318"></a>0,003 039 194 6 | <a id="p100319"></a>0,000 125 262 5 |
| <a id="p100320"></a>значение_относительной_распространенности_референсного_образца_1 | <a id="p100321"></a>0,001 694 538 5 | <a id="p100322"></a>6,003 822 041 x e-05 |
| <a id="p100323"></a>...... | <a id="p100324"></a>...... | <a id="p100325"></a>...... |
| <a id="p100326"></a>значение_относительной_распространенности_референсного_образца_N | <a id="p100327"></a>0,002 179 311 8 | <a id="p100328"></a>3,318 616 67 x e-05 |


<a id="p100329"></a>A.6 Общая относительная распространенность генов
<a id="p100330"></a>A.6.1 Общие положения
<a id="p100331"></a>Данные могут быть в текстовом формате и отображаться со строкой заголовка и строкой данных. Общая информация об относительном распространении генов в метагеномике содержится в строке данных.
<a id="p100332"></a>A.6.2 Строка заголовка
<a id="p100333"></a>Строка заголовка имеет N + 2 (N - количество референсных образцов) фиксированных полей, каждое поле связано с вкладкой, как показано ниже:
<a id="p100334"></a>[1]. # ID_гена.
<a id="p100335"></a>[2]. значение_относительной_распространенности_образца.
<a id="p100336"></a>[3]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_1.
<a id="p100337"></a>......
<a id="p100338"></a>[N]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_N.
<a id="p100339"></a>A.6.3 Строка данных
<a id="p100340"></a>Каждая строка имеет N + 2 (N - количество референтных образцов) фиксированных полей, каждое поле соединено табуляцией, а нулевое значение каждого поля использует точку "." для представления. Соответствующая информация о поле выглядит следующим образом.
<a id="p100341"></a>[1]. ID_гена: Идентификаторы гена, тип строки, можно использовать идентификатор гена NCBI Entrez, см. в https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/.
<a id="p100342"></a>[2]. значение_относительной_распространенности_образца: Общие значения относительной распространенности генов образца, показаны в виде десятичной дроби.
<a id="p100343"></a>[3]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_1: Общие значения относительной распространенности генов референтного образца 1, показаны в виде десятичной дроби.
<a id="p100344"></a>......
<a id="p100345"></a>[N]. значение_относительной_распространенности_референсного_образца_N: Общие значения относительной распространенности генов референтного образца N, показаны в виде десятичной дроби.
<a id="p100346"></a>A.6.4 Таблица примеров

<a id="p100347"></a>Таблица A.6

<a id="p100348"></a>Примеры общей относительной распространенности генов


| <a id="p100349"></a>Заголовок списка | <a id="p100350"></a>Пример 1 | <a id="p100351"></a>Пример 2 |
| --- | --- | --- |
| <a id="p100352"></a># ID_ГЕНА | <a id="p100353"></a>25 604 | <a id="p100354"></a>56 324 |
| <a id="p100355"></a>значение_относительной_распространенности_образца | <a id="p100356"></a>0,003 039 194 6 | <a id="p100357"></a>0,000 125 262 5 |
| <a id="p100358"></a>значение_относительной_распространенности_референсного_образца_1 | <a id="p100359"></a>0,001 694 538 5 | <a id="p100360"></a>6,003 822 041 x e-05 |
| <a id="p100361"></a>...... | <a id="p100362"></a>...... | <a id="p100363"></a>...... |
| <a id="p100364"></a>значение_относительной_распространенности_референсного_образца_N | <a id="p100365"></a>0,002 179 311 8 | <a id="p100366"></a>3,318 616 67 x e-05 |






<a id="p100367"></a>Приложение B
(справочное)

<div align="right">

<a id="p100368"></a>КАТАЛОГ ЭЛЕМЕНТОВ ДАННЫХ

</div>


<div align="center">

<a id="p100369"></a>Таблица B.1

<a id="p100370"></a>Каталог секвенирования информационных элементов

</div>



<table>
<colgroup><col width="59%"><col width="9%"><col width="8%"><col width="8%"><col width="16%"></colgroup>
<tr><td><a id="p100371"></a>Наименование</td><td><a id="p100372"></a>Защита</td><td><a id="p100373"></a>Ед.</td><td><a id="p100374"></a>Тип</td><td><a id="p100375"></a>Допустимое значение</td></tr>
<tr><td><a id="p100376"></a>Идентификатор списка задач</td><td><a id="p100377"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100378"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100379"></a>Название списка задач</td><td><a id="p100380"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100381"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100382"></a>Тип секвенирования</td><td><a id="p100383"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100384"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100385"></a>Название платформы секвенирования</td><td><a id="p100386"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100387"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100388"></a>Идентификатор секвенатора</td><td><a id="p100389"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100390"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100391"></a>Название секвенатора</td><td><a id="p100392"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100393"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100394"></a>Название библиотеки</td><td><a id="p100395"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100396"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100397"></a>Номер библиотеки</td><td><a id="p100398"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100399"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100400"></a>Стратегия библиотеки</td><td><a id="p100401"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100402"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100403"></a>Чип N</td><td><a id="p100404"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100405"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100406"></a>Дорожка N</td><td><a id="p100407"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100408"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100409"></a>Машина N</td><td><a id="p100410"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100411"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100412"></a>Путь хранения исходных данных секвенирования</td><td><a id="p100413"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100414"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100415"></a>Уникальный номер файлов FASTQ</td><td><a id="p100416"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100417"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100418"></a>Время начала секвенирования</td><td><a id="p100419"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100420"></a>DT</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100421"></a>Время завершения секвенирования</td><td><a id="p100422"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100423"></a>DT</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100424"></a>Место завершения</td><td><a id="p100425"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100426"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td colspan="5"><a id="p100427"></a>Примечание - Тип "S" относится к "Строке", "DT" относится к "Дате и времени".</td></tr>
</table>


<div align="center">

<a id="p100428"></a>Таблица B.2

<a id="p100429"></a>Каталог анализа элементов биологической информации

</div>



<table>
<colgroup><col width="59%"><col width="9%"><col width="8%"><col width="8%"><col width="16%"></colgroup>
<tr><td><a id="p100430"></a>Наименование</td><td><a id="p100431"></a>Защита</td><td><a id="p100432"></a>Ед.</td><td><a id="p100433"></a>Тип</td><td><a id="p100434"></a>Допустимое значение</td></tr>
<tr><td><a id="p100435"></a>Путь хранения данных</td><td><a id="p100436"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100437"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100438"></a>Наименование ПО</td><td><a id="p100439"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100440"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100441"></a>Версия ПО</td><td><a id="p100442"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100443"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100444"></a>Параметр ПО</td><td><a id="p100445"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100446"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td colspan="5"><a id="p100447"></a>Примечание - Тип "S" относится к "Строке".</td></tr>
</table>


<div align="right">

<a id="p100448"></a>Таблица B.3

</div>


<div align="center">

<a id="p100449"></a>Каталог метагеномных элементов

</div>



<table>
<colgroup><col width="59%"><col width="9%"><col width="8%"><col width="8%"><col width="16%"></colgroup>
<tr><td><a id="p100450"></a>Наименование</td><td><a id="p100451"></a>Защита</td><td><a id="p100452"></a>Ед.</td><td><a id="p100453"></a>Тип</td><td><a id="p100454"></a>Допустимые значения</td></tr>
<tr><td><a id="p100455"></a>Метагеномный код</td><td><a id="p100456"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100457"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100458"></a>Название гена</td><td><a id="p100459"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100460"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100461"></a>Значение гена</td><td><a id="p100462"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100463"></a>N</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100464"></a>Длина гена</td><td><a id="p100465"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100466"></a>N</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100467"></a>Описание целостности</td><td><a id="p100468"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100469"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100470"></a>Происхождение микробного сообщества</td><td><a id="p100471"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100472"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100473"></a>Классификация филума</td><td><a id="p100474"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100475"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100476"></a>Значение количества микробного филума</td><td><a id="p100477"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100478"></a>N</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100479"></a>Классификация рода</td><td><a id="p100480"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100481"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100482"></a>Значение микробных видов</td><td><a id="p100483"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100484"></a>N</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100485"></a>Классификация видов</td><td><a id="p100486"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100487"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100488"></a>Значение количества микробных видов</td><td><a id="p100489"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100490"></a>N</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100491"></a>Аннотация (аннотация KO)</td><td><a id="p100492"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100493"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100494"></a>Аннотация линейных гомологичных генов</td><td><a id="p100495"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100496"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100497"></a>Частота, с которой ген присутствует во всех образцах</td><td><a id="p100498"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100499"></a>N</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100500"></a>Частота, с которой ген присутствует во всех особях</td><td><a id="p100501"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100502"></a>N</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100503"></a>Функциональная классификация аннотации KEGG</td><td><a id="p100504"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100505"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100506"></a>Функциональная классификация аннотации eggNOG</td><td><a id="p100507"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100508"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100509"></a>Оцениваемое происхождение сообщества</td><td><a id="p100510"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100511"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td><a id="p100512"></a>Функция микробного сообщества</td><td><a id="p100513"></a>Нет</td><td></td><td><a id="p100514"></a>S</td><td></td></tr>
<tr><td colspan="5"><a id="p100515"></a>Примечание - Тип "S" относится к "Строке", "N" относится к "Числу".</td></tr>
</table>






<div align="right">

<a id="p100516"></a>Приложение ДА<br>
(справочное)

</div>


<a id="p100517"></a>СВЕДЕНИЯ О СООТВЕТСТВИИ ССЫЛОЧНОГО МЕЖДУНАРОДНОГО СТАНДАРТА

<div align="center">

**НАЦИОНАЛЬНОМУ СТАНДАРТУ**

<a id="p100518"></a>**Таблица ДА.1**

</div>



<table>
<colgroup><col width="31%"><col width="12%"><col width="58%"></colgroup>
<tr><td><a id="p100519"></a>Обозначение ссылочного международного стандарта</td><td><a id="p100520"></a>Степень соответствия</td><td><a id="p100521"></a>Обозначение и наименование соответствующего национального стандарта</td></tr>
<tr><td><a id="p100522"></a>ISO 20397-1:2022</td><td><a id="p100523"></a>IDT</td><td><a id="p100524"></a><a href="https://bukva.ai/docs/standart-gost-r-iso-20397-1-2025">ГОСТ Р ИСО 20397-1-2025</a> "Биотехнология. Массовое параллельное секвенирование. Часть 1. Подготовка нуклеиновой кислоты и библиотеки"</td></tr>
<tr><td colspan="3"><a id="p100525"></a><a id="p100526"></a>Примечание - В настоящей таблице использовано следующее условное обозначение степени соответствия стандарта:<br>- IDT - идентичный стандарт.</td></tr>
</table>







## <a id="p100527"></a>БИБЛИОГРАФИЯ



<table>
<colgroup><col width="6%"><col width="24%"><col width="69%"></colgroup>
<tr><td><a id="p100528"></a>[1]</td><td><a id="p100529"></a>ISO/IEC 11179-1:2015 <a href="#p100555">&lt;1&gt;</a></td><td><a id="p100530"></a>Information technology - Metadata registries (MDR) - Part 1: Framework (Информационная технология. Регистры метаданных (РМД). Часть 1. Основные положения)</td></tr>
<tr><td><a id="p100531"></a>[2]</td><td><a id="p100532"></a>ISO 17115:2007 <a href="#p100556">&lt;2&gt;</a></td><td><a id="p100533"></a>Health informatics - Vocabulary for terminological systems (Информатика в здравоохранении. Словарь терминологических систем)</td></tr>
<tr><td><a id="p100534"></a>[3]</td><td><a id="p100535"></a>ISO 20691:2022</td><td><a id="p100536"></a>Biotechnology - Requirements for data formatting and description in the life sciences (Биотехнология. Требования к форматированию и описанию данных в области медико-биологических наук)</td></tr>
<tr><td><a id="p100537"></a>[4]</td><td><a id="p100538"></a>ISO/TS 21089:2018</td><td><a id="p100539"></a>Health informatics - Trusted end-to-end information flows (Информатизация здоровья. Потоки конфиденциальной сквозной информации)</td></tr>
<tr><td><a id="p100540"></a>[5]</td><td><a id="p100541"></a>ISO 20397-2:2021</td><td><a id="p100542"></a>Biotechnology - Massively parallel sequencing - Part 2: Quality evaluation of sequencing data (Биотехнология. Массовое параллельное секвенирование. Часть 2. Оценка качества данных секвенирования)</td></tr>
<tr><td><a id="p100543"></a>[6]</td><td><a id="p100544"></a>ISO 21962:2003</td><td><a id="p100545"></a>Space data and information transfer systems - Data entity dictionary specification language (DEDSL) - PVL syntax (Космические системы передачи данных и информации. Язык спецификаций для словаря информационного объекта. Синтаксис PVL)</td></tr>
<tr><td><a id="p100546"></a>[7]</td><td colspan="2"><a id="p100547"></a>Field D, Garrity G, Gray T et al. The minimum information about a genome sequence (MIGS) specification. Nat Biotechnol. 2008; 26(5):541 - 7. Nature group. Available at: doi: 10.1038/nbt1360</td></tr>
<tr><td><a id="p100548"></a>[8]</td><td colspan="2"><a id="p100549"></a>Simon H. Ye., Katherine J. Siddle, Daniel J. Park et al. Benchmarking Metagenomics Tools for Taxonomic Classification. Cell. 2019; 8; 178(4):779 - 794. Available at: doi: 10.1016/j.cell.2019.07.010.</td></tr>
<tr><td><a id="p100550"></a>[9]</td><td colspan="2"><a id="p100551"></a>Amos, G.C.A., Logan A., Anwar S. et al. Developing standards for the microbiome field. Microbiome 8, 98 (2020). Available at: doi: 10.1186/s40168-020-00856-3</td></tr>
<tr><td><a id="p100552"></a>[10]</td><td colspan="2"><a id="p100553"></a>Yong-Xin Liu, Yuan Qin, Tong Chen et al. A practical guide to amplicon and metagenomic analysis of microbiome data. Protein Cell. 2021; 12(5):315 - 330. Available at: doi: 10.1007/s13238-020-00724-8</td></tr>
</table>



<a id="p100554"></a>

---

<a id="p100555"></a><1> В настоящее время действует ISO/IEC 11179-1:2023.
<a id="p100556"></a><2> В настоящее время действует ISO 17115:2020 "Health informatics - Representation of categorial structures of terminology (CatStructure)".






<table>
<colgroup><col width="50%"><col width="50%"></colgroup>
<tr><td><a id="p100557"></a>УДК 658:5:006.354</td><td><a id="p100558"></a>ОКС 07.080</td></tr>
<tr><td colspan="2"><a id="p100559"></a>Ключевые слова: ДНК, массовое параллельное секвенирование, метагеномное секвенирование, метод "дробовика", формат данных</td></tr>
</table>




<a id="p100560"></a>

---