| Наименование таможенного | Вводится в штатное расписание | Сокращается из штатного расписания |
| органа | заместитель начальника РТУ, таможни (ответственный за организацию таможенного оформления и контроля) | заместитель начальника РТУ, таможни по экономическим вопросам | заместитель начальника РТУ, таможни по правоохранительной работе | заместитель начальника РТУ, таможни по работе с личным составом |
| первый заместитель начальника РТУ, таможни |
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
| Восточно-Сибирское таможенное управление | 1 | 1 | | | |
| Таможни, подчиненные ВСТУ: | | | | | |
| Борзинская | 1 | 1 | | | |
| Братская | 1 | 1 | | | |
| Бурятская | 1 | 1 | | | |
| Забайкальская | 1 | 1 | | | |
| Иркутская | 1 | 1 | | | |
| Красноярская | 1 | 1 | | | |
| Наушкинская | 1 | 1 | | | |
| Тувинская | 1 | 1 | | | |
| Хакасская | 1 | 1 | | | |
| Читинская | 1 | 1 | | | |
| Дальневосточное таможенное управление | 1 | | 1 | | |
| Таможни, подчиненные ДВТУ: | | | | | |
| Амурская | 1 | 1 | | | |
| Артемовская Биробиджанская | 1 1 | 1 | 1 | | |
| Благовещенская | 1 | 1 | | | |
| Бухта Провидения | 1 | 1 | | | |
| Ванинская | 1 | 1 | | | |
| Владивостокская | 1 | 1 | | | |
| Восточная | 1 | 1 | | | |
| Гродековская | 1 | 1 | | | |
| Корсаковская | 1 | 1 | | | |
| Магаданская | 1 | 1 | | | |
| Находкинская | 1 | 1 | | | |
| Невельская | 1 | 1 | | | |
| Нерюнгринская | 1 | 1 | | | |
| Петропавловск- | | | | | |
| Камчатская | 1 | 1 | | | |
| Тындинская | 1 | 1 | | | |
| Уссурийская | 1 | 1 | | | |
| Хабаровская | 1 | 1 | | | |
| Хасанская | 1 | 1 | | | |
| Холмская | 1 | 1 | | | |
| Южно-Сахалинская | 1 | 1 | | | |
| Якутская | 1 | 1 | | | |
| Западное таможенное управление | | | | | |
| Таможни, подчиненные ЗТУ: | | | | | |
| Белгородская | 1 | 1 | | | |
| Брянская | 1 | 1 | | | |
| Владимирская | 1 | 1 | | | |
| Воронежская | 1 | 1 | | | |
| Ивановская | 1 | 1 | | | |
| Калужская | 1 | 1 | | | |
| Костромская | 1 | 1 | | | |
| Курская | 1 | 1 | | | |
| Липецкая | 1 | 1 | | | |
| Орловская | 1 | 1 | | | |
| Рязанская | 1 | 1 | | | |
| Смоленская | 1 | 1 | | | |
| Тамбовская | 1 | 1 | | | |
| Тверская | 1 | 1 | | | |
| Тульская | 1 | 1 | | | |
| Ярославская | 1 | 1 | | | |
| Западно-Сибирское таможенное управление | 1 | 1 | | | |
| Таможни, подчиненные ЗСТУ: | | | | | |
| Алтайская | 1 | 1 | | | |
| Горно-Алтайская | 1 | 1 | | | |
| Кузбасская | 1 | 1 | | | |
| Новосибирская | 1 | 1 | | | |
| Новокузнецкая | 1 | 1 | | | |
| Омская | 1 | 1 | | | |
| Толмачевская | 1 | 1 | | | |
| Томская | 1 | 1 | | | |
| Калининградское таможенное управление | | | | | |
| Таможни, подчиненные КТУ: | | | | | |
| Мамоновская Черняховская | 1 1 | | 1 | | 1 |
| Московское таможенное управление | | | | | |
| Таможни, подчиненные МТУ: | | | | | |
| Жуковская | 1 | 1 | | | |
| Зеленоградская | 1 | 1 | | | |
| Люберецкая | 1 | 1 | | | |
| Московская автогрузовая | 1 | 1 | | | |
| Московская выставочная | 1 | 1 | | | |
| Московская железнодорожная | 1 | 1 | | | |
| Московская почтово-багажная | 1 | 1 | | | |
| Ногинская | 1 | 1 | | | |
| Одинцовская | 1 | 1 | | | |
| Подольская | 1 | 1 | | | |
| Щелковская | 1 | 1 | | | |
| Поволжское таможенное управление | | | | | |
| Таможни, подчиненные ПТУ: | | | | | |
| Кировская Марийская | 1 1 | 1 | 1 | | |
| Мордовская Нижегородская | 1 1 | 1 | 1 | | |
| Пензенская | 1 | 1 | | | |
| Самарская Саратовская | 1 1 | 1 | 1 | | |
| Тольяттинская | 1 | 1 | | | |
| Ульяновская | 1 | 1 | | | |
| Чувашская | 1 | 1 | | | |
| Северо-Западное таможенное управление | | | | | |
| Таможни, подчиненные СЗТУ: | | | | | |
| Архангельская Балтийская | 1 1 | 1 | | 1 | |
| Великолукская Вологодская | 1 1 | 1 | 1 | | |
| Выборгская | 1 | 1 | | | |
| Вяртсильская | 1 | 1 | | | |
| Кандалакшская Кингисеппская | 1 1 | 1 | | 1 | |
| Костомукшская Мурманская | 1 1 | 1 | 1 | | |
| Новгородская | 1 | 1 | | | |
| Петрозаводская | 1 | 1 | | | |
| Печорская | 1 | 1 | | | |
| Псковская Пулковская | 1 1 | 1 | 1 | | |
| Пыталовская | 1 | 1 | | | |
| Санкт- | | | | | |
| Петербургская | 1 | 1 | | | |
| Себежская | 1 | 1 | | | |
| Сыктывкарская | 1 | 1 | | | |
| Северо-Кавказское таможенное управление | | | | | |
| Таможни, подчиненные СКТУ: | | | | | |
| Адыгейская | 1 | 1 | | | |
| Астраханская | 1 | 1 | | | |
| Ингушская | 1 | 1 | | | |
| Кабардино- | | | | | |
| Балкарская | 1 | 1 | | | |
| Карачаево- | | | | | |
| Черкесская Краснодарская | 1 1 | 1 | 1 | | |
| Миллеровская Минераловодская | 1 1 | 1 | 1 | | |
| Новороссийская | 1 | 1 | | | |
| Нижневолжская | 1 | 1 | | | |
| Ростовская | 1 | 1 | | | |
| Северо-Осетинская | 1 | 1 | | | |
| Сочинская | 1 | 1 | | | |
| Ставропольская | 1 | 1 | | | |
| Таганрогская | 1 | 1 | | | |
| Темрюкская | 1 | 1 | | | |
| Туапсинская | 1 | 1 | | | |
| Татарское таможенное управление | 1 | | 1 | | |
| Таможни, подчиненные ТТУ: | | | | | |
| Казанская | 1 | 1 | | | |
| Набережночелнинская | 1 | 1 | | | |
| Уральское таможенное управление | 1 | 1 | | | |
| Таможни, подчиненные УТУ: | | | | | |
| Екатеринбургская | 1 | 1 | | | |
| Удмуртская | 1 | 1 | | | |
| Кольцовская | 1 | 1 | | | |
| Магнитогорская | 1 | 1 | | | |
| Нижнетагильская | 1 | 1 | | | |
| Новоуренгойская | 1 | 1 | | | |
| Оренбургская | 1 | 1 | | | |
| Орская | 1 | 1 | | | |
| Пермская | 1 | 1 | | | |
| Сургутская | 1 | 1 | | | |
| Тюменская | 1 | 1 | | | |
| Таможни, непосредственно подчиненные ГТК | | | | | |
| России: | | | | | |
| Внуковская | 1 | 1 | | | |
| Домодедовская | 1 | 1 | | | |
| Чкаловская | 1 | 1 | | | |
| Энергетическая | 1 | 1 | | | |
| Итого | 137 | 122 | 12 | 2 | 1 |