Письмо ФНС России от 27.03.2026 № СД-36-3/2378@

<Об освобождении от исполнения обязанностей налогоплательщика организации, получившей статус участника проекта по осуществлению исследовательской и научно-технологической деятельности>

ФНС России в связи с обращениями территориальных налоговых органов по вопросу применения освобождения от исполнения обязанностей налогоплательщика по налогу на прибыль организаций (далее — освобождение), предусмотренного статьей 246.1 Налогового кодекса Российской Федерации (далее — Кодекс), сообщает следующее.

Письмом Минфина России от 02.03.2026 № 03-03-08/16021 согласована позиция ФНС России, изложенная в письме от 26.12.2025 № СД-4-3/11686@, о возможности возобновления применения освобождения, предусмотренного статьей 246.1 Кодекса, в случае утраты и последующего получения статуса участника проекта («Сколково» либо ИНТЦ), а также в случае утраты статуса участника проекта «Сколково» при одновременном наличии статуса участника проекта ИНТЦ (в пределах 10-летнего срока, исчисляемого со дня получения первоначального статуса участника проекта, при условии, что организация не отказывалась от освобождения в порядке абзаца второго пункта 5 статьи 246.1 Кодекса).

В целях выработки единой позиции относительно даты, с которой организация вправе возобновить применение освобождения, а также определения случаев, при которых возникает обязанность по восстановлению и уплате в бюджет сумм налога с начислением соответствующих пеней, просим согласовать (подтвердить) следующие подходы.

Пунктом 1 статьи 246.1 Кодекса предусмотрено, что организации, получившие статус участников проекта «Сколково» либо статус участников проекта ИНТЦ, в течение 10 лет со дня получения ими статуса участников проекта имеют право на освобождение в порядке и на условиях, которые предусмотрены главой 25 Кодекса.

В соответствии с пунктом 4 статьи 246.1 Кодекса участник проекта вправе использовать право на освобождение с 1-го числа месяца, следующего за месяцем, в котором был получен статус участника проекта.

При этом положения статьи 246.1 Кодекса не содержат запрета на повторное применение освобождения (продолжение применения освобождения) с 1-го числа месяца, следующего за месяцем, в котором был получен статус участника проекта повторно («Сколково либо ИНТЦ), если в течение этого года освобождение уже применялось, но было прекращено в соответствии с абзацем вторым пункта 2 статьи 246.1 Кодекса (при утрате статуса участника проекта) (в пределах 10-летнего срока, исчисляемого со дня получения первоначального статуса участника проекта, при условии, что организация не отказывалась от освобождения в порядке абзаца второго пункта 5 статьи 246.1 Кодекса).»

В соответствии с абзацем вторым пункта 2 статьи 246.1 Кодекса участник проекта утрачивает право на освобождение при утрате статуса участника проекта — с 1-го числа налогового периода, в котором такой статус был утрачен.

Сумма налога за налоговый период, в котором наступили соответствующие обстоятельства, подлежит восстановлению и уплате в бюджет в установленном порядке с взысканием с участника проекта соответствующих сумм пеней (пункт 3 статьи 246.1 Кодекса).

Учитывая изложенное:

1. В случае если организация, прекратившая применение освобождения в соответствии с абзацем вторым пункта 2 статьи 246.1 Кодекса в связи с утратой статуса участника проекта, в последующем получает в том же налоговом периоде статус участника проекта повторно («Сколково» либо ИНТЦ), такая организация вправе возобновить применение освобождения с даты, определяемой пунктом 4 статьи 246.1 Кодекса, то есть с 1-го числа месяца, следующего за месяцем получения статуса участника проекта повторно («Сколково» либо ИНТЦ) (в пределах 10-летнего срока, исчисляемого со дня получения первоначального статуса участника проекта, при условии, что организация не отказывалась от освобождения в порядке абзаца второго пункта 5 статьи 246.1 Кодекса).

При этом в указанном случае с учетом пункта 3 статьи 246.1 Кодекса организация восстанавливает и уплачивает в бюджет сумму налога и соответствующие пени за период с 1-го числа налогового периода по дату, предшествующую дате возобновления применения освобождения, определяемую в соответствии с пунктом 4 статьи 246.1 Кодекса.

2. В случае если на дату утраты статуса участника проекта «Сколково» у организации имеется право на применение освобождения в качестве участника проекта ИНТЦ (при этом не имеет значения, возникло ли указанное право на начало налогового периода либо в течение налогового периода до даты утраты статуса участника проекта «Сколково»), утрата статуса участника проекта «Сколково» сама по себе не влечет утрату права на освобождение, предусмотренного статьей 246.1 Кодекса.

В указанном случае применение освобождения осуществляется непрерывно (без восстановления и уплаты налога в бюджет, а также без начисления пеней) (в пределах 10-летнего срока, исчисляемого со дня получения первоначального статуса участника проекта, при условии, что организация не отказывалась от освобождения в порядке абзаца второго пункта 5 статьи 246.1 Кодекса).

3. В случае если на дату утраты статуса участника проекта «Сколково» организация имеет статус участника проекта ИНТЦ, однако право на применение освобождения в качестве участника проекта ИНТЦ еще не возникло (с учетом пункта 4 статьи 246.1 Кодекса), основания для непрерывного применения освобождения отсутствуют.

Например, организация утратила статус участника проекта «Сколково» 20.05.2025 года, статус участника проекта ИНТЦ получен 18.05.2025 (право на освобождение в силу пункта 4 статьи 246.1 Кодекса как участником проекта ИНТЦ возникает с 01.06.2025 года).

В таком случае организация вправе возобновить применение освобождения с даты возникновения права на освобождение в качестве участника проекта ИНТЦ, определяемой пунктом 4 статьи 246.1 Кодекса (в пределах 10-летнего срока, исчисляемого со дня получения первоначального статуса участника проекта, при условии, что организация не отказывалась от освобождения в порядке абзаца второго пункта 5 статьи 246.1 Кодекса).

При этом с учетом пункта 3 статьи 246.1 организация восстанавливает и уплачивает в бюджет сумму налога и соответствующие пени за период с 1-го числа налогового периода по дату, предшествующую дате возобновления применения освобождения, определяемую в соответствии с пунктом 4 статьи 246.1 Кодекса.

---