МР 4.2.2017-20. 4.2. Методы контроля. Биологические и микробиологические факторы. Методы идентификации и количественного определения ГМ-кукурузы MON87419, MON87427 и ГМ-рапса MS11. Методические рекомендации

(утв. Роспотребнадзором 07.10.2020)

Утверждаю

4.2 МЕТОДЫ КОНТРОЛЯ. БИОЛОГИЧЕСКИЕ

И МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ ФАКТОРЫ

I. Общие положения и область применения

1.1. Наращивание производства и импорта генетически модифицированных сельскохозяйственных растений и продуктов их переработки, повышение вероятности попадания пищевой продукции, полученной из генетически модифицированных источников или с их использованием, на российский продовольственный рынок обусловливает необходимость разработки методики идентификации присутствия компонентов генно-инженерно-модифицированных организмов (далее — ГМО), не зарегистрированных в Российской Федерации. Контроль и мониторинг продукции, содержащей ГМО, обеспечивает биобезопасность Российской Федерации, предупреждая проникновение и расселение ГМО на территории Российской Федерации.

Имеется большое количество стратегий скрининга и идентификации ГМО в различных лабораториях по всему миру. Современная тенденция заключается в создании систем, способных осуществлять скрининг максимального количества известных в настоящее время ГМО в процессе одного исследования. Еще одной современной тенденцией является комбинирование таких систем с базами данных, что может значительно повысить эффективность скрининга [4, 9 - 11].

1.2. Настоящие методические рекомендации (далее — МР) содержат описание методов идентификации и количественного определения событие-специфичной рекомбинантной ДНК (ГМ-специфичной ДНК), характерной для уникальных трансформационных событий генетически модифицированной кукурузы (далее — ГМ-кукурузы) MON87419, MON87427 и генетически модифицированного рапса (далее — ГМ-рапса) MS11.

Данные методы, основанные на полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (далее — ПЦР-РВ) по технологии TaqMan <1>, могут быть использованы для контроля за ГМО в пищевых продуктах, а также в сырье (семена, зерна и другой материал растительного происхождения).

1.3. Интерпретация результатов ПЦР-РВ и расчет содержания ГМО основаны на применении относительного анализа по двум калибровочным кривым.

1.4. МР могут применяться при контроле растительного сырья и пищевых продуктов на наличие ГМО на этапах гигиенической экспертизы, государственной регистрации, закупки, ввоза и реализации в Российской Федерации.

1.5. МР предназначены для лабораторий организаций Роспотребнадзора, осуществляющих контроль за качеством и безопасностью продовольственного сырья и пищевых продуктов, в том числе импортируемых в Российскую Федерацию, а также могут быть использованы в лабораториях организаций, аккредитованных в установленном порядке.

II. Сущность метода

2.1. Метод выявления компонентов ГМО, не зарегистрированных в Российской Федерации, основан на использовании ПЦР-РВ. Интерпретация результатов ПЦР-РВ и расчет содержания ГМО базируется на применении относительного анализа по двум калибровочным кривым.

2.2. Идентификация и количественное определение ГМО методом относительного анализа по двум калибровочным кривым включает использование двух независимых систем ПЦР-РВ (реакций, проводимых в отдельных пробирках), каждая из которых имеет специфичные ДНК-праймеры и флуоресцентно-меченые зонды:

• одна ПЦР-система выявляет последовательность области ДНК, специфичной для соответствующего трансформационного события (ГМ-специфичная ДНК);
• другая ПЦР-система выявляет последовательность области ДНК, специфичной для соответствующего вида растения (таксон-специфичная ДНК).

2.3. Для построения калибровочных кривых могут быть использованы соответствующие сертифицированные стандартные образцы (далее — ССО <2>) с известным содержанием ДНК. Построение первой калибровочной кривой (для ГМ-специфичной ДНК) выполняется по результатам ГМ-специфичной ПЦР-РВ, а второй (для таксон-специфичной ДНК) — по результатам таксон-специфичной ПЦР-РВ.

<2> Могут использоваться ССО Института контрольных материалов и измерений (англ. Institute for Reference Materials and Measurements (JRC-IRMM) [ec.europa.eu/jrc/en/reference-materials/catalogue], ССО Американского общества химиков масложировой промышленности (англ. American Oil Chemists Society; AOCS) [www.aocs.org/crm], или эквивалентные образцы, применение которых приводит к тем же результатам.

III. Оборудование и материалы

3.1 Испытательное и вспомогательное оборудование

Примечание. Допускается использование испытательного и вспомогательного оборудования с аналогичными или лучшими метрологическими характеристиками.

3.2 Расходные материалы

Примечание. Допускается использование расходных материалов с характеристиками не хуже указанных.

3.3 Реактивы

IV. Методы идентификации и количественного определения линий ГМ-кукурузы (MON87419, MON87427)

4.1. Метод идентификации и количественного определения кукурузы линии MON87419 основан на ПЦР-РВ. Мишенями для анализа являются:

• область ДНК, специфичная для трансформационного события MON87419, расположенная на границе геномной ДНК кукурузы и генно-инженерной конструкции;
• таксон-специфичная для кукурузы целевая последовательность — ген hmg, кодирующий синтез группы ядерных белков с высокой подвижностью (англ. high mobility group, HMG).

4.1.1. Предел обнаружения метода составляет не менее 5 геномных копий кукурузы линии MON87419 на реакцию; предел количественного определения метода составляет не менее 0,085% в 200 нг ДНК кукурузы.

4.1.2. Схема разведений и концентрации растворов для построения калибровочных кривых (из расчета массы генома кукурузы, равной 2,73 пкг [8]), протокол состава праймеров и зондов, состав реакционных смесей и режим амплификации представлены в таблицах 1 - 4. Для приготовления раствора 1 (табл. 1) может быть использован стандартный образец, содержащий 10% ДНК кукурузы линии MON87419. Для количественного определения трансформационного события MON87419 используется реакционная смесь (табл. 3) согласно протоколу Объединенного Научного Центра Европейского Союза (англ. Joint Research Centre, далее — JRC) [5]. Допускается применение других реактивов с техническими и метрологическими характеристиками не хуже указанных.

Таблица 1

используемых для построения калибровочной кривой

Таблица 2

<*> Реакционная смесь, согласно протоколу JRC для количественного определения трансформационного события MON87419. Допускается применение других реактивов с техническими и метрологическими характеристиками не хуже указанных.

Температурно-временной режим амплификации <*>

<*> Согласно протоколу JRC для количественного определения трансформационного события MON87419. Температурно-временной режим должен быть скорректирован с учетом рекомендаций производителя реакционной смеси.

4.2. Метод идентификации и количественного определения кукурузы линии MON87427 основан на ПЦР-РВ. Мишенями для анализа являются:

• область ДНК, специфичная для трансформационного события MON87427, расположенная на границе геномной ДНК кукурузы и генно-инженерной генетической конструкции;
• таксон-специфичная для кукурузы целевая последовательность — ген hmg.

4.2.1. Предел обнаружения метода составляет не менее 0,04% в 200 нг ДНК кукурузы; предел количественного определения метода составляет не менее 0,085% в 200 нг ДНК кукурузы.

4.2.2. Схема разведений и концентрации растворов для построения калибровочных кривых (из расчета массы генома кукурузы, равной 2,73 пкг [8]), протокол состава праймеров и зондов, состав реакционных смесей и режим амплификации представлены в табл. 5 - 8. Для приготовления раствора 1 (табл. 5) может быть использован 100% ССО, кат. № AOCS 0512-A2. Для количественного определения трансформационного события MON87427 используется реакционная смесь (табл. 7) согласно протоколу JRC [6]. Допускается применение других реактивов с техническими и метрологическими характеристиками не хуже указанных.

Таблица 5

используемых для построения калибровочной кривой

Таблица 6

<*> Реакционная смесь, согласно протоколу JRC для количественного определения трансформационного события MON87427. Допускается применение других реактивов с техническими и метрологическими характеристиками не хуже указанных.

Температурно-временной режим амплификации <*>

<*> Согласно протоколу JRC для количественного определения трансформационного события MON87427. Температурно-временной режим должен быть скорректирован с учетом рекомендаций производителя реакционной смеси.

V. Метод идентификации и количественного определения ГМ-рапса линии MS11

5.1. Метод идентификации и количественного определения рапса линии MS11 основан на ПЦР-РВ. Мишенями для анализа являются:

• область ДНК, специфичная для трансформационного события MS11, расположенная на границе геномной ДНК рапса и генно-инженерной генетической конструкции.
• таксон-специфичная для рапса масличного целевая последовательность — ген круциферина A (CruA).

5.1.1. Предел обнаружения метода составляет не менее 0,023% в 200 нг ДНК рапса; предел количественного определения метода составляет не менее 0,08% в 200 нг ДНК рапса.

5.1.2. Схема разведений и концентрации растворов для построения калибровочных кривых (из расчета массы генома рапса, равной 1,15 пкг [8]), протокол состава праймеров и зондов, состав реакционных смесей и режим амплификации представлены в табл. 13 - 16. Для приготовления раствора 1 (табл. 9) может быть использован 100% ССО, кат. № AOCS 1116-A. Для количественного определения трансформационного события MS11 используется реакционная смесь (табл. 11) согласно протоколу JRC [7]. Допускается применение других реактивов с техническими и метрологическими характеристиками не хуже указанных.

Количество геномных копий ГМ-рапса в растворах ДНК, используемых для построения калибровочной кривой

Таблица 10

<*> Согласно протоколу JRC для количественного определения трансформационного события MS11. Температурно-временной режим должен быть скорректирован с учетом рекомендаций производителя реакционной смеси.

VI. Интерпретация результатов

6.1. Полученные в ходе испытания данные (кривые накопления флуоресцентного сигнала) анализируют по одному каналу детекции с использованием программного обеспечения прибора.

6.2. Результаты интерпретируют на основании наличия (или отсутствия) пересечения кривой флуоресценции с установленной на соответствующем уровне пороговой линией на графике зависимости интенсивности флуоресценции от количества циклов, что соответствует значению порогового цикла Ct для каждой реакции.

6.3. Калибровочными точками являются значения пороговых циклов Ct, которым соответствуют логарифмы количества копий ДНК растворов, приготовленных из ССО. Калибровочная кривая строится по калибровочным точкам, что может быть сделано с помощью электронных таблиц или непосредственно в программном обеспечении прибора. По полученным калибровочным кривым путем линейной интерполяции рассчитывается количество копий ГМ-специфичной ДНК и таксон-специфичной ДНК в анализируемых пробах.

6.4. Содержание ГМО в пробе представляет собой отношение количества копий ГМ-специфичной ДНК к количеству копий таксон-специфичной ДНК, выраженное в процентах. Расчет производят по формуле:

\text{ГМО},\% = \frac{\text{Количество ГМ } - \text{специфичной ДНК}}{\text{Количество таксон} - \text{специфичной ДНК}} \times 100

Библиографические ссылки