Статья 13. Орган дознания и дознаватель не может принимать участие в расследовании уголовного дела и подлежит отводу, если он является по своему служебному положению непосредственным начальником или подчиненным лица, подозреваемого (обвиняемого) в совершении преступления, если имеются иные обстоятельства, дающие основание полагать, что он лично, прямо или косвенно заинтересован в исходе данного уголовного дела, а также при наличии иных оснований, указанных в ст. 61 УПК РФ.Инструкция органам дознания Вооруженных Сил Российской Федерации, других войск, воинских формирований и органов, в которых законом предусмотрена военная служба

Статья 14. При наличии оснований для отвода орган дознания — командир воинской части или дознаватель обязан устраниться от участия в производстве по уголовному делу независимо от того, известно ли об этих обстоятельствах сторонам или другим участникам уголовного судопроизводства и настаивают ли они на его устранении или нет (ч. 1 ст. 62 УПК РФ).

В случае, если орган дознания — командир воинской части или дознаватель не устранился от участия в производстве по уголовному делу, отвод ему может быть заявлен участниками уголовного судопроизводства (ч. 2 ст. 62 УПК РФ).

Решение об отводе органа дознания — командира воинской части или дознавателя принимает военный прокурор. Предыдущее участие органа дознания — командира воинской части или дознавателя в производстве предварительного расследования по данному уголовному делу не является основанием для его отвода (ст. 67 УПК РФ).

Оформленный в письменной форме отвод или самоотвод приобщается к материалам уголовного дела. Отвод, заявленный устно, заносится в протокол следственного действия.

Уголовное дело незамедлительно направляется военному прокурору для решения вопроса об отводе органа дознания — командира воинской части или дознавателя в порядке, предусмотренном УПК РФ.